More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1766 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 446 aa  913    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  56.02 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  55.56 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  54.82 
 
 		 433 aa  494  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  54.11 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  36.05 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  36.04 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.81 
 
 		 446 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  37.42 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  36.49 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  36.24 
 
 		 442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  35.37 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  37.5 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  36.38 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  35.06 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  35.1 
 
 		 440 aa  263  6.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  36.61 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  34.57 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.35 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.13 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  36.9 
 
 		 439 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  34.76 
 
 		 446 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  37.6 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  36.24 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  34.16 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.78 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  34.76 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.59 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.1 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  35.68 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.38 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  34.96 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.86 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.2 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  34.66 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  34.97 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.69 
 
 		 442 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.27 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.66 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  34.92 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 		 443 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  35.93 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  34.68 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.37 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  34.54 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  34.9 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  33.86 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.93 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  32.66 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  34.3 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.78 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  31.91 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  35.06 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  35.76 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  35.15 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 		 469 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  34.67 
 
 		 468 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  32.51 
 
 		 447 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  33.83 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  33.62 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  30.99 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  32.58 
 
 		 448 aa  230  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  34.88 
 
 		 478 aa  229  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  33.78 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  35.12 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>