More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1098 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
433 aa  883    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  68.6 
 
 
430 aa  614  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  65.5 
 
 
431 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  64.57 
 
 
431 aa  597  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  54.82 
 
 
446 aa  494  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  37.98 
 
 
439 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  38.3 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  37.93 
 
 
439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  35.67 
 
 
444 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 
446 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 
439 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.41 
 
 
444 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  37.61 
 
 
448 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  35.52 
 
 
461 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.46 
 
 
447 aa  260  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.41 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  35.94 
 
 
449 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  35.17 
 
 
442 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.88 
 
 
444 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.75 
 
 
445 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  35.65 
 
 
444 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 
446 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 
444 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 
444 aa  257  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  35.39 
 
 
440 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.65 
 
 
444 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.89 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  34.74 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  36.09 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  35.88 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  34.67 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  34.61 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  36.6 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 
446 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.14 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  35.57 
 
 
442 aa  253  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 
443 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  34.44 
 
 
446 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  35.16 
 
 
453 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 
443 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 
444 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.29 
 
 
445 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.52 
 
 
456 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  34.71 
 
 
443 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  35.33 
 
 
447 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  34.89 
 
 
447 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  33.94 
 
 
441 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 
443 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
442 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  34.38 
 
 
443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  34 
 
 
446 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 
441 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  35.12 
 
 
443 aa  245  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.14 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  37.13 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.86 
 
 
444 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.51 
 
 
441 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 
452 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  35.08 
 
 
444 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
443 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
448 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
449 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  34.6 
 
 
446 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 
433 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.38 
 
 
446 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 
456 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 
444 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  34.81 
 
 
449 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.65 
 
 
442 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  35.91 
 
 
450 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.25 
 
 
447 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
443 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.36 
 
 
443 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.31 
 
 
440 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  34.3 
 
 
450 aa  237  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.48 
 
 
446 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.48 
 
 
446 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  33.64 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 
448 aa  234  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  36.74 
 
 
446 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  35.43 
 
 
447 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  34 
 
 
451 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 
448 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 
446 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  35.43 
 
 
447 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  35.66 
 
 
446 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
477 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  33.04 
 
 
447 aa  229  8e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 
446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 
446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 
446 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  34.44 
 
 
451 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  32.21 
 
 
445 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>