More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0960 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  59.12 
 
 		 728 aa  883    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.8 
 
 		 722 aa  668    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  49.02 
 
 		 714 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  56.87 
 
 		 728 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  46.72 
 
 		 695 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 723 aa  1502    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  47.23 
 
 		 723 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  48.48 
 
 		 727 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  48.72 
 
 		 705 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.16 
 
 		 714 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 726 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  47.65 
 
 		 695 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.79 
 
 		 699 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.98 
 
 		 713 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  60.96 
 
 		 732 aa  915    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  46.79 
 
 		 718 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.44 
 
 		 695 aa  636    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  48.37 
 
 		 721 aa  655    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  45.64 
 
 		 727 aa  636    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  59.61 
 
 		 724 aa  879    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.52 
 
 		 697 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  58.71 
 
 		 729 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  71.23 
 
 		 727 aa  1089    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  46.66 
 
 		 695 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  47.95 
 
 		 734 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  72.24 
 
 		 729 aa  1102    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.8 
 
 		 695 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.27 
 
 		 714 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 712 aa  689    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  45.74 
 
 		 716 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  45.34 
 
 		 726 aa  632  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  45.22 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  46.35 
 
 		 701 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  45.77 
 
 		 706 aa  633  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  46.85 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  46.49 
 
 		 717 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  45.31 
 
 		 726 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  46.59 
 
 		 721 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  44.79 
 
 		 696 aa  622  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  45.1 
 
 		 725 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  44.54 
 
 		 702 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  44.13 
 
 		 723 aa  616  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  44.26 
 
 		 702 aa  615  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  45.27 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  45.87 
 
 		 723 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  45.71 
 
 		 725 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  45.47 
 
 		 730 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  46.73 
 
 		 723 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  46.58 
 
 		 711 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  44.17 
 
 		 722 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  45.08 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  43.09 
 
 		 724 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  43.73 
 
 		 733 aa  595  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  43.54 
 
 		 729 aa  595  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  44.68 
 
 		 703 aa  591  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  42.49 
 
 		 730 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  42.11 
 
 		 724 aa  579  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  41.5 
 
 		 699 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  41.19 
 
 		 676 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.2 
 
 		 688 aa  489  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  35.59 
 
 		 716 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  35.94 
 
 		 688 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  31.85 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.11 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.35 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  33.56 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  25.97 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  30.57 
 
 		 454 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  35.29 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  30.67 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  29.94 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  32.5 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  29.17 
 
 		 439 aa  62  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  28 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  30 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  30 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  30 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  25.62 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  39.53 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  29.03 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  30.19 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.64 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  25.97 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.62 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.78 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  33.98 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.2 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  26.96 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.25 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  28.29 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  28.66 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.66 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  31.21 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  28.57 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>