More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0442 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
688 aa  1412    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  42.18 
 
 
697 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  43.5 
 
 
699 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  42.73 
 
 
697 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  41.88 
 
 
701 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 
695 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  41.01 
 
 
695 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  41.4 
 
 
705 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  40.2 
 
 
702 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  39.97 
 
 
695 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  40.61 
 
 
726 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  41.52 
 
 
697 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  40.11 
 
 
734 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  42.32 
 
 
702 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  39.14 
 
 
695 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  40.38 
 
 
696 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  39.29 
 
 
695 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  39.04 
 
 
697 aa  513  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  39.69 
 
 
712 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  39.4 
 
 
727 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  39.18 
 
 
718 aa  513  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  39.77 
 
 
716 aa  514  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  40.17 
 
 
717 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  39.83 
 
 
714 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  39.54 
 
 
721 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  39.32 
 
 
722 aa  511  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  40.26 
 
 
727 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  39.97 
 
 
732 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  39.46 
 
 
729 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  39.86 
 
 
726 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  40.06 
 
 
726 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  39.05 
 
 
703 aa  503  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  37.89 
 
 
714 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  38.59 
 
 
706 aa  501  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  39 
 
 
728 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  39.04 
 
 
728 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  37.72 
 
 
697 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  39.16 
 
 
723 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  38.12 
 
 
714 aa  494  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  37.87 
 
 
713 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  38.2 
 
 
723 aa  489  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  38.62 
 
 
730 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  39.65 
 
 
711 aa  485  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  38.45 
 
 
725 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  38.69 
 
 
723 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  39.02 
 
 
733 aa  482  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  39.57 
 
 
676 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  38.39 
 
 
729 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 
730 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  38.92 
 
 
724 aa  475  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  38.18 
 
 
725 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  38.54 
 
 
723 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  36.54 
 
 
722 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  41.58 
 
 
727 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  36.88 
 
 
723 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  37.05 
 
 
721 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  36.59 
 
 
724 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  36.38 
 
 
724 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  36.26 
 
 
729 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  35.59 
 
 
699 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  33.53 
 
 
688 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  31.64 
 
 
716 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0418  L-glutamine synthetase  27.23 
 
 
472 aa  65.1  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.23 
 
 
444 aa  64.7  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  28.15 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  24.46 
 
 
439 aa  62  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  31.88 
 
 
449 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.24 
 
 
439 aa  61.2  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30 
 
 
445 aa  60.5  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  26.54 
 
 
459 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 
456 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  33.02 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  30.95 
 
 
451 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 
445 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  24.23 
 
 
440 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  34.38 
 
 
444 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 
439 aa  59.3  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  31 
 
 
447 aa  58.9  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 
445 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  31.16 
 
 
448 aa  58.5  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  32.98 
 
 
447 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  30.16 
 
 
451 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  28.47 
 
 
446 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  31.53 
 
 
446 aa  58.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  25.39 
 
 
446 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 
444 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  25.12 
 
 
453 aa  57.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  32.98 
 
 
413 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 
444 aa  57.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  31.91 
 
 
447 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  25.23 
 
 
461 aa  57.4  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>