More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3524 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 444 aa  922    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  64.53 
 
 		 451 aa  594  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  50.23 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  50.7 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  49.42 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  49.42 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  49.18 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  43.22 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  43.45 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  42.76 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  43.56 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  42.63 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  42.3 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  42.76 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  42.3 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  42.3 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  43.45 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  47.69 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  43.35 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  45.92 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  42.76 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  46.17 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44.24 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  43.11 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  42.53 
 
 		 458 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  43.11 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  42.03 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  44.75 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  41.84 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  41.84 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  43.15 
 
 		 466 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  44.29 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  43.71 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  42.89 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  42 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  42.79 
 
 		 455 aa  342  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  41.61 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  42.07 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  42.3 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  42.07 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  42.07 
 
 		 454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  41.84 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  41.44 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  41.38 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  38.9 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.05 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  39.95 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  41.15 
 
 		 471 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  41.22 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  39.73 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  41.38 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  39.17 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  39.5 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  41.15 
 
 		 454 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  40.68 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  40.68 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  40.68 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  40.68 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  40.68 
 
 		 472 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  40.45 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  40.45 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  40.45 
 
 		 472 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  40.23 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  40.45 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  38.16 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  39.37 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  38.39 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  38.81 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  39.22 
 
 		 445 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  37.73 
 
 		 444 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  38.85 
 
 		 445 aa  289  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  38.25 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  38.57 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  38.57 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  37.36 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  38.16 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  38.16 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  38.16 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  38.89 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  39.17 
 
 		 445 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  38.16 
 
 		 456 aa  285  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  39.22 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  38.66 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  39.22 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  39.22 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  37.13 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  38.13 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  37.13 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  38.89 
 
 		 445 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  38.32 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  37.64 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  38.57 
 
 		 445 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  37.19 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3041  glutamate--ammonia ligase  38.71 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  38.3 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  36.96 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  38.34 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  38.34 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  35.65 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  38.53 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>