More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0584 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 465 aa  956    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  51.49 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  51.06 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  51.06 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  51.49 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  51.06 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  52.13 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  51.06 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  51.49 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  50.85 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  50.64 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  53.12 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  40.45 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  40.31 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  40.31 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  40.31 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  41.24 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  41.22 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  40.18 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  40.4 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  40.77 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  40.09 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  39.87 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  39.29 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  39.87 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  38.75 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  39.64 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  38.53 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  38.53 
 
 		 458 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  39.12 
 
 		 451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  38.67 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  38.26 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  34.61 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  36.53 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  37 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  33.85 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  37.84 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.12 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  37.39 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  35.65 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  37.39 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  36.28 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  35.63 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  37.86 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  37.42 
 
 		 455 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  34.42 
 
 		 453 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  37.56 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  36.32 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  35.47 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  37.75 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.21 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  35.36 
 
 		 448 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  35.14 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  34.15 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  36.97 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  34.91 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  35.43 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  34.61 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  36.08 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  35.14 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  36.08 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.78 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.78 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.78 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  34.46 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  34.68 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  34.83 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  35.63 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  33.62 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  33.62 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  34.38 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  36.02 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  34 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  33.62 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  34.38 
 
 		 490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  34.15 
 
 		 456 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  35.57 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  34.79 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  34.08 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  33.94 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.92 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  36.32 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  33.48 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  33.48 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  33.48 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.78 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  33.41 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  35.12 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  34.16 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  33.04 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  34.11 
 
 		 456 aa  229  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 452 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  34.16 
 
 		 451 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>