More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0955 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 461 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  45.19 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  45.41 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  44.97 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  44.97 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  44.94 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  44.97 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  44.74 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.3 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  44.52 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  44.3 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  44.52 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  44.52 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  44.52 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  44.87 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  44.07 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  44.44 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  44.22 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  44.22 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  43.12 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  43.17 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  43.35 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  41.06 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  41.83 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  41.07 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  40.62 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  40.62 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  40.62 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  40.62 
 
 		 472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 472 aa  355  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  41.8 
 
 		 466 aa  349  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.46 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  39.25 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  39.6 
 
 		 455 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  39.69 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  40.81 
 
 		 454 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  39.37 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  38.57 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  40.44 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  38.79 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  38.79 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  38.69 
 
 		 455 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  38.67 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.15 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  38.67 
 
 		 454 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  37.93 
 
 		 468 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  37.93 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  38.91 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  37.9 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  39.78 
 
 		 448 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  38.86 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  39.56 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  37.03 
 
 		 443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  39.33 
 
 		 448 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  39.06 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  39.59 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  37.73 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  36.57 
 
 		 451 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  36.67 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  37 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  38.36 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  36.73 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  36.77 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  37.36 
 
 		 439 aa  282  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  36.22 
 
 		 448 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  36.22 
 
 		 448 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  36.22 
 
 		 448 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  34.61 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  36.67 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  36.28 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  36.06 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  36.94 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  36.94 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  36.44 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  36.71 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  37.33 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  35.82 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  36.2 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  37.1 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  35.82 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  35.18 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  36.2 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  35.6 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  36.47 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  37.76 
 
 		 456 aa  269  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  35.94 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  34.52 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  35.38 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  34.29 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  34.07 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  34.29 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34.07 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.79 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.79 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>