More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0375 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 445 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 445 aa  915    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  97.75 
 
 		 445 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  74.94 
 
 		 443 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  67.19 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  61.38 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  52.49 
 
 		 455 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  48.76 
 
 		 451 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  49.42 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  41.65 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  39.24 
 
 		 458 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  39.46 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  39.91 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  37.3 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  39.96 
 
 		 463 aa  319  7e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  39.33 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  39.1 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  39.1 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  38.88 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  38.51 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  39.1 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  38.51 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38.88 
 
 		 458 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  41 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  37.61 
 
 		 458 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.2 
 
 		 472 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  37.16 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  37.16 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.22 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.44 
 
 		 460 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  39.67 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.01 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  38.26 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  39.11 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.89 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  37.98 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  38.62 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  38.43 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  40.83 
 
 		 450 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  36.94 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  39.91 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  40.09 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  38.41 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  38.88 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.63 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  36.4 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  36.4 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  36.4 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  36.4 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  36.4 
 
 		 472 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  36.18 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  36.18 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  38.64 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  36.18 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  37.67 
 
 		 454 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  37.44 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  37.44 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  41.32 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  39.72 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  37.16 
 
 		 454 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  37.89 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  36.94 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  35.65 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  35.73 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  35.73 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  35.78 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  35.5 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  35.19 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  35.27 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  35.03 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  35.03 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  35.03 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  35.5 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  35.27 
 
 		 452 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  35.27 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  35.27 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  36.68 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  37.19 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.8 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  35.86 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  35.35 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  35.27 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  35.41 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  35.12 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  35.41 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  36.45 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  35.12 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  36.45 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  36.45 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  36.36 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  36.45 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  34.57 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.96 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  36.36 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  36.13 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  36.51 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  35.58 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>