More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3702 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  74.94 
 
 		 445 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  74.72 
 
 		 445 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  74.94 
 
 		 445 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 443 aa  906    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  69.61 
 
 		 479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  61.61 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  52.04 
 
 		 455 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  50.7 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  47.71 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  38.24 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  38.96 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  38.96 
 
 		 458 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  41.81 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  42.69 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  38.96 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  38.83 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  38.96 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  38.6 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  38.83 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  38.51 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38.6 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.34 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  37.7 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.12 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.12 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.57 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  39.39 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  38.15 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  37.25 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  37.02 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  38.43 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  41.82 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  37.03 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  37.08 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  39.29 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  39.13 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.26 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  37.22 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  38.26 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  38.44 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  37.53 
 
 		 472 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  40.24 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  38.03 
 
 		 464 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  38.22 
 
 		 459 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  38.22 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  37.59 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  40.55 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  39.22 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  37.21 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  36.84 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  39.64 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  38.81 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.18 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  35.96 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  36.07 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  35.96 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  35.96 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  35.96 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  40.47 
 
 		 458 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  35.6 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  35.6 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  35.6 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  35.96 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  38.13 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  37.99 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  37.05 
 
 		 459 aa  277  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  37.38 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  36.62 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  36.62 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  36.34 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  37.58 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  37.44 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  35.9 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  37.47 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  35.92 
 
 		 461 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.83 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  37.23 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  35.75 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  35.36 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  35.51 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  35.8 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  35.73 
 
 		 476 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  35.12 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  37.44 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  36.3 
 
 		 444 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  35.98 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  35.98 
 
 		 444 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  35.35 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  35.92 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  35.35 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  35.12 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  35.35 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34.66 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  36.08 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  34.31 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  37.35 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  34.43 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  35.12 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  35.12 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  35.2 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>