More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0887 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 459 aa  923    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  52.61 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  53.04 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  52.61 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  45.8 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  45.98 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  45.35 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  44.71 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  44.85 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  43.3 
 
 		 454 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  42.86 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  43.3 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  43.08 
 
 		 454 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  46.09 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  44.77 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  45.19 
 
 		 454 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  42.86 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  43.43 
 
 		 454 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  39.39 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  39.18 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  40.18 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  38.5 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38.31 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  38.31 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  38.94 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  38.05 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  38.96 
 
 		 458 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  38.1 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.79 
 
 		 460 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.79 
 
 		 460 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  38.1 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  38.5 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  39.22 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.79 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  38.72 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.33 
 
 		 460 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  40.94 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  37.89 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  39.61 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  39.06 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  40.6 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  38.39 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.81 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.81 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.81 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.81 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.81 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.81 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.81 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.81 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  37.58 
 
 		 472 aa  289  9e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.26 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.48 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  37.05 
 
 		 443 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  36.7 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  36.32 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  36.03 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  34.49 
 
 		 479 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  34.97 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  34.97 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  36.11 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.19 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.19 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.19 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  34.72 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  34.49 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  34.49 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.49 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  34.57 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  34.57 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  32.06 
 
 		 466 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  34.57 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  33.79 
 
 		 456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  32.95 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.56 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  34.92 
 
 		 451 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  34.85 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  32.95 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  33.8 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  33.56 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  33.56 
 
 		 490 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  33.56 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  32.72 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  32.49 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  33.1 
 
 		 444 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.94 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  34.17 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  34.17 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  33.1 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  31.29 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  32.57 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2988  glutamate--putrescine ligase  32.42 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>