More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44240 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  84.8 
 
 		 454 aa  782    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  84.8 
 
 		 454 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  85.24 
 
 		 459 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  83.92 
 
 		 454 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  97.8 
 
 		 454 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  72.75 
 
 		 455 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  85.02 
 
 		 454 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  76.04 
 
 		 455 aa  705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  84.55 
 
 		 471 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  100 
 
 		 454 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  75.6 
 
 		 455 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  65.93 
 
 		 455 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  50.11 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  51.09 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  47.23 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  46.78 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  46.55 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44.57 
 
 		 460 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.3 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  43.27 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  44.12 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  44.12 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  43.85 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  44.12 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  44.07 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  43.27 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  43.4 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  43.18 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  42.63 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  42.95 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  43.4 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  42.95 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  42.76 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  45.19 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  42.31 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  42.95 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  41.2 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  40.81 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  42.99 
 
 		 451 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  41.15 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  45.39 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  42.27 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  40.66 
 
 		 466 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  38.13 
 
 		 443 aa  299  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.61 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  38.55 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  38.29 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  39.77 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.39 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.39 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.39 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.39 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.39 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.39 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.39 
 
 		 472 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.39 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  38.39 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  37.17 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  36.22 
 
 		 445 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  35.76 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  35.76 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  37.97 
 
 		 452 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  37.24 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  37.12 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  37.35 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  35.94 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  37.12 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  36.61 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  36.88 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  36.88 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  36.41 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  36.41 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  36.41 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  35.93 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  36.3 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  36.17 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  36.18 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  35.93 
 
 		 452 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  35.55 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  35.93 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  34.82 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  34.82 
 
 		 490 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  35.7 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  35.55 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.19 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.32 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  35.04 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  35.04 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  34.97 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  35.71 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  34.97 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  34.97 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  36.02 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  36.56 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  36.53 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  34.6 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  34.6 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  34.6 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.27 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>