More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3001 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  79.6 
 
 		 449 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  73.39 
 
 		 452 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  71.84 
 
 		 452 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  80.93 
 
 		 449 aa  775    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  73.39 
 
 		 452 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  85.37 
 
 		 451 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  96.9 
 
 		 451 aa  915    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  72.95 
 
 		 452 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  71.62 
 
 		 452 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  95.34 
 
 		 451 aa  902    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  74.5 
 
 		 452 aa  719    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  72.95 
 
 		 452 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  71.84 
 
 		 468 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  72.95 
 
 		 452 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  73.39 
 
 		 452 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  72.06 
 
 		 452 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  72.51 
 
 		 452 aa  705    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  97.12 
 
 		 451 aa  916    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3032  glutamate--ammonia ligase  90.69 
 
 		 451 aa  870    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  95.34 
 
 		 451 aa  902    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  95.34 
 
 		 451 aa  902    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  72.06 
 
 		 452 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  95.34 
 
 		 451 aa  902    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  73.84 
 
 		 452 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  83.81 
 
 		 449 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  99.78 
 
 		 451 aa  936    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 451 aa  937    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  91.13 
 
 		 451 aa  872    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  80.71 
 
 		 449 aa  772    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  72.73 
 
 		 452 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  71.84 
 
 		 453 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  99.78 
 
 		 451 aa  936    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  55.65 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  55.65 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  56.1 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  55.88 
 
 		 444 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  56.12 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  56.35 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  56.32 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  56.32 
 
 		 490 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  56.92 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  56.1 
 
 		 444 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  56.35 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  56.35 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  56.12 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  55.88 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  55.88 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  55.68 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  56.1 
 
 		 446 aa  537  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  55.88 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  56.1 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  56.1 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  55.88 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  55.9 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  56.1 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  54.77 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6343  L-glutamine synthetase  56.42 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2903  glutamate--putrescine ligase  56.19 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  55.88 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  56.44 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  56.19 
 
 		 445 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  56.19 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3041  glutamate--ammonia ligase  56.19 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  56.19 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  56.44 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  56.44 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  53.76 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2988  glutamate--putrescine ligase  55.31 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  54.48 
 
 		 456 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  54.32 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  53.12 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  51.88 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  52.64 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  52.46 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  52.81 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  53.14 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  50.78 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  52.13 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  50.22 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3517  glutamate--putrescine ligase  54.32 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  52.63 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  51.01 
 
 		 478 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  49.21 
 
 		 478 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  49.56 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  48.09 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1397  glutamate--ammonia ligase  47.64 
 
 		 452 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  48.54 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  47.87 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1838  L-glutamine synthetase  49.55 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277584  normal  0.270137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  47.76 
 
 		 475 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  48.21 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1125  L-glutamine synthetase  46.98 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441387  normal  0.264596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0365  Glutamate--putrescine ligase  48.54 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0812253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2226  glutamine synthetase family protein  48.32 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0864  glutamate--putrescine ligase  46.19 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  49.66 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  45.74 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  45.74 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2233  glutamate--ammonia ligase  45.95 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2188  glutamate--putrescine ligase  45.72 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000050762  unclonable  0.00000655518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>