More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4677 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  100 
 
 		 456 aa  950    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  51.55 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  51.77 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  51.12 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  51.34 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  52.01 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  51.79 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  51.79 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  50.44 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  51.34 
 
 		 458 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  51.56 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  51.12 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  50.22 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  50.22 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  50.67 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  50.45 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  50.45 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  50.22 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  50.56 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  48.44 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  48.21 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  47.56 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  47.56 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  47.56 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  47.56 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  44.94 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  44.06 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  42.63 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.26 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  40.57 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  40.57 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.52 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  40.98 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  40.76 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  41.78 
 
 		 455 aa  356  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  41.02 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  36.98 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  40.45 
 
 		 465 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  39.43 
 
 		 466 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  42.11 
 
 		 454 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  40.53 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  40.98 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  40.53 
 
 		 454 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  41.2 
 
 		 454 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  40.7 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  40.62 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  40.31 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  38.31 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  38.53 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  38.31 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  38.24 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  37.25 
 
 		 453 aa  325  9e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  37.89 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  37.98 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  37.3 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  37.3 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  38.34 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  38.74 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  35.76 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  35.76 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.6 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  36.38 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  36.07 
 
 		 452 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.38 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  34.6 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.38 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  36.32 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  36.99 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  35.87 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  35.87 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.87 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  35.89 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  35.87 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  33.93 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  34.15 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  37.83 
 
 		 459 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.71 
 
 		 452 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  36.07 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  35.87 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  35.08 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  34.85 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  35.47 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  37.44 
 
 		 461 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  33.48 
 
 		 452 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.21 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.21 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  33.48 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.21 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  36.73 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.44 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  36.73 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  37.44 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>