More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00464 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  100 
 
 		 459 aa  931    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  47.51 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  47.51 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  47.51 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  47.51 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  48.85 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  49.08 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  48.85 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  48.39 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  48.16 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  48.16 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  48.62 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  48.16 
 
 		 458 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  47.47 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  47.47 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  47.47 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  47.47 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  47.82 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  46.54 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  42.26 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  44.29 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  43.35 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  42.61 
 
 		 466 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  45.12 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  42.99 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  42.99 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  42.99 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  42.99 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  42.46 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  42.99 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  42.99 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  42.99 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  42.76 
 
 		 472 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  42.7 
 
 		 472 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  42.53 
 
 		 472 aa  352  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  42.57 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  46.31 
 
 		 455 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  46.31 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  45.62 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  45.39 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  45.16 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  45.16 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  42.48 
 
 		 455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  43.43 
 
 		 455 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  45.39 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  44.32 
 
 		 454 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  42.98 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  42.59 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.6 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  40.5 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  43.79 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  42.19 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  39.61 
 
 		 459 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  43.09 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  40.32 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  40.32 
 
 		 464 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  39.64 
 
 		 464 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  40.65 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  43.09 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  38.75 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  41.03 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  42.12 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  40.09 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  40.09 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  40.41 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  38.57 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  38.34 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  38.11 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  38.52 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  38.48 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  36.87 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  36.12 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  39.44 
 
 		 448 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  35.08 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  38.75 
 
 		 448 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  38.52 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  34.82 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  35.08 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  34.51 
 
 		 476 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  32.88 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  37.64 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  33.48 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  37.64 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  35.13 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  37.64 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  34.51 
 
 		 476 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  35.84 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  35.51 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  32.65 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.42 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  34.19 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  32.65 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  33.95 
 
 		 444 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.49 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.02 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  37.41 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  32.79 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  32.79 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>