More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4278 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  78.79 
 
 		 448 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  79.24 
 
 		 448 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  76.42 
 
 		 448 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  81.18 
 
 		 451 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  92.86 
 
 		 448 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  91.96 
 
 		 448 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  98.88 
 
 		 448 aa  905    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  93.53 
 
 		 448 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 448 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  79.02 
 
 		 448 aa  739    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  91.96 
 
 		 448 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  91.96 
 
 		 448 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  57.37 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  36.77 
 
 		 460 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  36.77 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  36.77 
 
 		 460 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  35.86 
 
 		 458 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  36.24 
 
 		 460 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  35.84 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  34.97 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  36.77 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 		 458 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  34.74 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  39.82 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  34.74 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  34.74 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  34.52 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  34.52 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  34.52 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  35.25 
 
 		 458 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  34.3 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  34.52 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  34.81 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.75 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.75 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.75 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.75 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  38.31 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  37.53 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.75 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.75 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.75 
 
 		 472 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  38.1 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  37.86 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  37.09 
 
 		 472 aa  267  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  35.7 
 
 		 456 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  38.75 
 
 		 459 aa  250  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  35.63 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  37.33 
 
 		 466 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  35.2 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  34.96 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  34.72 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  35.04 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  34.82 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  35.48 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  34 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  33.79 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  34.43 
 
 		 455 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  35.19 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  35.07 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.12 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  32.95 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  36.2 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.84 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  35.98 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  34.97 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  35.23 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.82 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  33.92 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  34.52 
 
 		 459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  33.78 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  33.7 
 
 		 468 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  34.84 
 
 		 450 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  33.56 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  35.54 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  35.12 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.54 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  35.54 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  34.38 
 
 		 455 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  35.35 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.33 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  35.09 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  35.09 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  35.09 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  35.09 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  33.63 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  34.02 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  34.86 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  35.45 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  34.86 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  34.86 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  32.96 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  32.96 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  32.96 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  32.96 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  33.63 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  33.79 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>