More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1836 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 439 aa  892    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  61.38 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  61.38 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  61.38 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  61.61 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  57.18 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  53.1 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  45.77 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  45.92 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  40.33 
 
 		 466 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  37.53 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  37.76 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  38.23 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  38.48 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  40 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  38.24 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  38 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  37.38 
 
 		 458 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  38.23 
 
 		 458 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  37.38 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  37.15 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  36.99 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  37.85 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  37.62 
 
 		 458 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  37.36 
 
 		 461 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  38.73 
 
 		 463 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  36.49 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  36.49 
 
 		 460 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  36.49 
 
 		 460 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  39.57 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  36.97 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  38.22 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  38.17 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  37.94 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  36.93 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  36.93 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  36.73 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  38.93 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  39.81 
 
 		 458 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  37.1 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  37.24 
 
 		 454 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  37.64 
 
 		 468 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  37.64 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  37.93 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  35.07 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  36.47 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  36.87 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  37.24 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  36.09 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  37.01 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  36.96 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  37.32 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  36.96 
 
 		 472 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  36.96 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  36.96 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  39.12 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  39.12 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  39.12 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  39.12 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  36.73 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.51 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  36.03 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  36.12 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  36.41 
 
 		 455 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  37.68 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  33.49 
 
 		 449 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  35.38 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  37.53 
 
 		 445 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  35.78 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  34.8 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  35.76 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  37.44 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  37.29 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  37.29 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  37.29 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  37.29 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  36.19 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  37.27 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  37.53 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  37.53 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  34.28 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  34.28 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  37.05 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.28 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.75 
 
 		 452 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  34.12 
 
 		 476 aa  230  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  37.05 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  35.84 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  37.05 
 
 		 490 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  37.11 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  35.34 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  37.11 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.18 
 
 		 453 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.75 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  34.52 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  37.05 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  33.88 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  37.35 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>