More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1921 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  64.44 
 
 		 726 aa  999    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  57.24 
 
 		 717 aa  815    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  56.77 
 
 		 722 aa  855    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  47.02 
 
 		 728 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  49.36 
 
 		 695 aa  692    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  48.51 
 
 		 697 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.5 
 
 		 711 aa  724    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  53.79 
 
 		 702 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 733 aa  1519    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  56.61 
 
 		 721 aa  829    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.83 
 
 		 727 aa  675    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.2 
 
 		 714 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  63.03 
 
 		 726 aa  979    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  54.85 
 
 		 699 aa  773    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  55.73 
 
 		 716 aa  800    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  58.13 
 
 		 723 aa  874    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  59.84 
 
 		 730 aa  907    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  62.57 
 
 		 723 aa  941    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  52.27 
 
 		 697 aa  734    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  53.73 
 
 		 729 aa  792    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  51.49 
 
 		 697 aa  726    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  48.53 
 
 		 712 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.55 
 
 		 695 aa  775    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  54.4 
 
 		 695 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  50.14 
 
 		 730 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  48.69 
 
 		 713 aa  685    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  48.13 
 
 		 714 aa  683    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  54.08 
 
 		 718 aa  802    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  47.86 
 
 		 696 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  64.94 
 
 		 727 aa  998    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 703 aa  709    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  53.68 
 
 		 724 aa  799    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  61.99 
 
 		 721 aa  916    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  64.53 
 
 		 723 aa  979    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  63.3 
 
 		 725 aa  941    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  54.75 
 
 		 695 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  54.62 
 
 		 705 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.54 
 
 		 722 aa  665    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  55.4 
 
 		 701 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  53.61 
 
 		 695 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.48 
 
 		 714 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  57.64 
 
 		 734 aa  835    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  53.53 
 
 		 697 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  52.45 
 
 		 724 aa  792    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  62.76 
 
 		 725 aa  942    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  64.8 
 
 		 726 aa  1004    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  61.34 
 
 		 723 aa  926    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.91 
 
 		 728 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  47.78 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  44.89 
 
 		 729 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  45.07 
 
 		 724 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  45.93 
 
 		 702 aa  621  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  45.5 
 
 		 727 aa  620  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.04 
 
 		 729 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  44.12 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  46.58 
 
 		 706 aa  610  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  44.11 
 
 		 723 aa  598  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  42.51 
 
 		 676 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  41.43 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.02 
 
 		 688 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37.17 
 
 		 688 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  37.57 
 
 		 716 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  45.35 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.49 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  26.43 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  29.03 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.14 
 
 		 447 aa  73.9  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  24.65 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  24.91 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  24.91 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  35.86 
 
 		 439 aa  70.5  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  24.3 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  27.05 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  40.7 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  28.33 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  24.91 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  27.05 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  26.9 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.48 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  36.05 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.74 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  28.07 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 		 445 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  26.64 
 
 		 473 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.48 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  25.99 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3142  L-glutamine synthetase  35.85 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  25.84 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  26.42 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>