More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0561 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.47 
 
 		 728 aa  653    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  49.93 
 
 		 723 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  60.09 
 
 		 695 aa  899    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.07 
 
 		 703 aa  725    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  49.35 
 
 		 730 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  51.5 
 
 		 717 aa  727    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  47.03 
 
 		 727 aa  661    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  46.52 
 
 		 714 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  46.68 
 
 		 722 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  51.29 
 
 		 726 aa  736    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  46.8 
 
 		 728 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  48.29 
 
 		 723 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  62.5 
 
 		 695 aa  929    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  52.22 
 
 		 711 aa  701    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  52.07 
 
 		 727 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 697 aa  726    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  51.58 
 
 		 723 aa  735    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  52.27 
 
 		 733 aa  730    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  62.97 
 
 		 697 aa  949    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  62.09 
 
 		 702 aa  927    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  48.51 
 
 		 730 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.38 
 
 		 714 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.57 
 
 		 718 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  49.21 
 
 		 723 aa  710    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  47.94 
 
 		 713 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  60.09 
 
 		 695 aa  897    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  50.92 
 
 		 721 aa  725    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  71.33 
 
 		 699 aa  1062    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  50.58 
 
 		 702 aa  731    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47 
 
 		 724 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  46.66 
 
 		 729 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  54.32 
 
 		 697 aa  761    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  55.62 
 
 		 696 aa  787    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  54.18 
 
 		 734 aa  779    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  56.67 
 
 		 695 aa  838    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  60.2 
 
 		 695 aa  908    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.03 
 
 		 714 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  47.8 
 
 		 712 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  53.43 
 
 		 706 aa  769    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  50.28 
 
 		 726 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  45.3 
 
 		 724 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  51.36 
 
 		 725 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  50.92 
 
 		 726 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  48.35 
 
 		 721 aa  698    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 697 aa  1446    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  51.57 
 
 		 716 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  60.26 
 
 		 697 aa  903    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  69.06 
 
 		 705 aa  1034    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  63.97 
 
 		 701 aa  945    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 722 aa  664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  51.22 
 
 		 725 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.22 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.03 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  44.79 
 
 		 729 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  45.03 
 
 		 724 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.84 
 
 		 729 aa  621  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  45.67 
 
 		 676 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.44 
 
 		 727 aa  608  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  42.18 
 
 		 688 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.06 
 
 		 699 aa  535  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.98 
 
 		 688 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  38.01 
 
 		 716 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  45.88 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  27.43 
 
 		 443 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.49 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  26.99 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.45 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  27.43 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  40.22 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.46 
 
 		 430 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  41.67 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.82 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  40.22 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  28.9 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  38.89 
 
 		 447 aa  67.4  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  41.11 
 
 		 444 aa  67  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.77 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.71 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0418  L-glutamine synthetase  29.67 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  31.21 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  43.68 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  40 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28.99 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  35.59 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  39.13 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  28.42 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  39.13 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  39.13 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  31.85 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>