More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0863 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  51.48 
 
 		 723 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  54.95 
 
 		 696 aa  773    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  49.86 
 
 		 722 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  50.48 
 
 		 722 aa  705    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  52.21 
 
 		 723 aa  742    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  53.72 
 
 		 702 aa  764    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  47.03 
 
 		 729 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  54 
 
 		 716 aa  754    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  54.57 
 
 		 721 aa  777    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  53.93 
 
 		 697 aa  753    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  47.72 
 
 		 727 aa  650    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 730 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  47.5 
 
 		 676 aa  650    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  51.06 
 
 		 727 aa  701    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50.14 
 
 		 714 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  53.64 
 
 		 726 aa  773    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  67.14 
 
 		 695 aa  994    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  50.99 
 
 		 723 aa  717    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  53.5 
 
 		 726 aa  755    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  56.34 
 
 		 734 aa  813    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  48.23 
 
 		 728 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  48.72 
 
 		 723 aa  672    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  57.12 
 
 		 695 aa  842    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  50.78 
 
 		 712 aa  708    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  64.03 
 
 		 695 aa  957    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  53.3 
 
 		 711 aa  733    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  52.71 
 
 		 718 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  54.35 
 
 		 703 aa  767    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  54.62 
 
 		 733 aa  773    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  64.17 
 
 		 695 aa  957    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.42 
 
 		 714 aa  704    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  45.57 
 
 		 724 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  54.38 
 
 		 727 aa  763    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  47.42 
 
 		 724 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  47.03 
 
 		 729 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  75.43 
 
 		 699 aa  1133    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  53.93 
 
 		 725 aa  752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  52.22 
 
 		 717 aa  733    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  53.28 
 
 		 706 aa  758    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  64.99 
 
 		 695 aa  972    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  50.35 
 
 		 714 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49.79 
 
 		 713 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  69.06 
 
 		 697 aa  1034    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  56 
 
 		 723 aa  791    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  47.44 
 
 		 724 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  47.9 
 
 		 732 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  54.14 
 
 		 725 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  50.93 
 
 		 697 aa  730    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  53.7 
 
 		 726 aa  758    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  66.09 
 
 		 702 aa  963    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  52.65 
 
 		 721 aa  747    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  46.8 
 
 		 729 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  70.16 
 
 		 697 aa  1038    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  65.17 
 
 		 697 aa  956    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 705 aa  1461    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  71.45 
 
 		 701 aa  1046    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  53.3 
 
 		 730 aa  736    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  47.94 
 
 		 728 aa  670    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  44.89 
 
 		 699 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  41.4 
 
 		 688 aa  542  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.93 
 
 		 688 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  40.6 
 
 		 716 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  38.95 
 
 		 450 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  41.76 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.4 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  27.65 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.52 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.92 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  32.8 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  37.93 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 444 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  38.71 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  39.53 
 
 		 443 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  37.89 
 
 		 449 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  27.92 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.37 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.87 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  35.51 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  26.4 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  27.41 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  37.93 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  30.58 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  30.4 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.06 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 443 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  36.26 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  26.61 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  24.08 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1612  L-glutamine synthetase  33.58 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  26.75 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  26.75 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  30.14 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  28.48 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  27.6 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>