More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4201 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  54.06 
 
 		 723 aa  798    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  53.43 
 
 		 727 aa  800    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  46.78 
 
 		 697 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  50.21 
 
 		 721 aa  708    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  50.36 
 
 		 717 aa  675    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  53.68 
 
 		 733 aa  796    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  54.09 
 
 		 721 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  72.93 
 
 		 729 aa  1112    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.65 
 
 		 699 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  54.53 
 
 		 726 aa  810    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  50.88 
 
 		 730 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  66.16 
 
 		 723 aa  1011    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  47.35 
 
 		 695 aa  663    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  54.91 
 
 		 723 aa  805    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  47.78 
 
 		 695 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  56.24 
 
 		 726 aa  832    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  50.07 
 
 		 718 aa  707    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  46.07 
 
 		 714 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  47.41 
 
 		 701 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  56.71 
 
 		 723 aa  832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 724 aa  1496    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  54.48 
 
 		 725 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  50.57 
 
 		 734 aa  713    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  45.57 
 
 		 705 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.99 
 
 		 695 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  48.93 
 
 		 730 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  76.93 
 
 		 724 aa  1168    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  54.21 
 
 		 725 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  54.87 
 
 		 726 aa  804    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  64.77 
 
 		 722 aa  988    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  46.14 
 
 		 712 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  50 
 
 		 716 aa  709    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  46.18 
 
 		 722 aa  632  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.37 
 
 		 727 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  46.86 
 
 		 695 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  47.22 
 
 		 702 aa  628  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 728 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  45.04 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  45.03 
 
 		 697 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  45.33 
 
 		 714 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  44.79 
 
 		 713 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  44.63 
 
 		 724 aa  618  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  44.95 
 
 		 697 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  44.78 
 
 		 728 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.31 
 
 		 729 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  44.71 
 
 		 703 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  45.57 
 
 		 711 aa  605  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  43.41 
 
 		 732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  44.29 
 
 		 695 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  43.61 
 
 		 727 aa  592  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  43.76 
 
 		 702 aa  586  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  44.68 
 
 		 696 aa  582  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  42.11 
 
 		 723 aa  579  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  44.25 
 
 		 697 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  41.28 
 
 		 729 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  44.07 
 
 		 697 aa  568  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  42.82 
 
 		 706 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  39.63 
 
 		 699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  37.27 
 
 		 676 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  36.59 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  36.65 
 
 		 688 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.89 
 
 		 716 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.07 
 
 		 439 aa  72  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.23 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  36.05 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.19 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  32.05 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  31.88 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  31.11 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  27.36 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  27.61 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  32.47 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  26.43 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1790  type I glutamine synthetase  30.77 
 
 		 490 aa  60.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.26 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  38.67 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  27.36 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  39.29 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  30.72 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.05 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.27 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  37.8 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  26.29 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  30 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  30.72 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  32.61 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  29.1 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.48 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.63 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  30.43 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  25.75 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>