More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1272 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 699 aa  1426    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  44.96 
 
 		 713 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  44.82 
 
 		 714 aa  608  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  44.44 
 
 		 714 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  43.87 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  43.61 
 
 		 722 aa  601  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  43.87 
 
 		 712 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  44.89 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  44.71 
 
 		 726 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  44.54 
 
 		 695 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  44.43 
 
 		 701 aa  598  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  42.32 
 
 		 725 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  43.73 
 
 		 697 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  44.17 
 
 		 723 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  42.9 
 
 		 714 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  43.29 
 
 		 721 aa  588  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  45.06 
 
 		 734 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  44.49 
 
 		 726 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  42.92 
 
 		 723 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  44.27 
 
 		 695 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  42.17 
 
 		 728 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  42.04 
 
 		 722 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  43.82 
 
 		 695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  43.58 
 
 		 726 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  43.12 
 
 		 699 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  43.71 
 
 		 695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  42.26 
 
 		 725 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  43.3 
 
 		 721 aa  575  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  42.57 
 
 		 727 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  41.49 
 
 		 695 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  43.43 
 
 		 730 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  42.57 
 
 		 697 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  43.08 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  44.95 
 
 		 730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  42.84 
 
 		 729 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  41.29 
 
 		 733 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  40.72 
 
 		 723 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  41.57 
 
 		 723 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  41.89 
 
 		 716 aa  557  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  40.45 
 
 		 732 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  41.27 
 
 		 702 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  42.06 
 
 		 697 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  41.07 
 
 		 729 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  40.35 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  41.84 
 
 		 727 aa  548  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  41.5 
 
 		 723 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  43.14 
 
 		 711 aa  544  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  40.49 
 
 		 724 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  42.23 
 
 		 697 aa  544  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  42.47 
 
 		 703 aa  544  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  40.51 
 
 		 728 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  42.47 
 
 		 718 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  41.58 
 
 		 706 aa  536  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  39.63 
 
 		 724 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  39.15 
 
 		 724 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  41.24 
 
 		 696 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  39.83 
 
 		 729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  39.8 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  36.74 
 
 		 676 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  35.59 
 
 		 688 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  35 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  34.43 
 
 		 716 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  25.67 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  27.38 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  26.42 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  26.15 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  26.89 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  26.6 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  31.47 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.35 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  26.03 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  25.34 
 
 		 441 aa  72  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  26.52 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  26.23 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  27.78 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  27.96 
 
 		 469 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  26.23 
 
 		 431 aa  70.5  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  24.64 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  26.58 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  30.77 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.15 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  26.61 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  30.35 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  27.96 
 
 		 469 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  24.92 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.88 
 
 		 443 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>