More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2596 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  69.24 
 
 
723 aa  1046    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  52.81 
 
 
730 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  56.42 
 
 
721 aa  809    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  63.03 
 
 
733 aa  950    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  45.77 
 
 
729 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  54.79 
 
 
695 aa  792    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  48.52 
 
 
727 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  50 
 
 
714 aa  679    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  75.14 
 
 
721 aa  1138    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  63.14 
 
 
726 aa  954    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  50.57 
 
 
714 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  49.43 
 
 
697 aa  672    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  59.26 
 
 
723 aa  880    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  53.63 
 
 
702 aa  749    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  54.09 
 
 
701 aa  763    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  51.84 
 
 
711 aa  733    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  48.78 
 
 
696 aa  653    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  48.86 
 
 
722 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  44.77 
 
 
728 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  49.71 
 
 
712 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  53.28 
 
 
695 aa  755    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  54.15 
 
 
699 aa  786    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  56.87 
 
 
730 aa  871    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  61.85 
 
 
727 aa  929    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  53.93 
 
 
705 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  63.22 
 
 
726 aa  947    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  54.11 
 
 
718 aa  781    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 
725 aa  1491    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  46.45 
 
 
702 aa  659    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  56.73 
 
 
717 aa  806    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  50.57 
 
 
697 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  54.48 
 
 
724 aa  789    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  46.14 
 
 
724 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  54.69 
 
 
695 aa  789    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  66.62 
 
 
723 aa  1019    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  53.86 
 
 
697 aa  771    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  48.57 
 
 
695 aa  686    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  51.22 
 
 
697 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  46.44 
 
 
728 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  57.76 
 
 
722 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  45.3 
 
 
732 aa  638    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  49.29 
 
 
713 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  64.01 
 
 
723 aa  953    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  55.22 
 
 
695 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  48.72 
 
 
714 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  57.08 
 
 
734 aa  827    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  54.07 
 
 
724 aa  796    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  53.66 
 
 
729 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  89.66 
 
 
725 aa  1364    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  62.81 
 
 
726 aa  953    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  55.48 
 
 
716 aa  804    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  51.55 
 
 
703 aa  728    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  47.15 
 
 
706 aa  634  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  48.06 
 
 
697 aa  632  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  44.03 
 
 
727 aa  624  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  44.32 
 
 
729 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  45.85 
 
 
723 aa  621  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  42.26 
 
 
699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  40.28 
 
 
676 aa  531  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  38.25 
 
 
688 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  38.24 
 
 
688 aa  435  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.83 
 
 
716 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  27.37 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  27.37 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  27.72 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.2 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  26.41 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  26.06 
 
 
470 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  29.84 
 
 
474 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.96 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  26.76 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  31.78 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  31.78 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  26.99 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  40.91 
 
 
447 aa  70.5  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  33.6 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  26.32 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.84 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.84 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  26.8 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  27.43 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  33.6 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  29.77 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  29.38 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  27.09 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  38.64 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  30.1 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  30.1 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  39.8 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>