More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1635 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1449  glutamine synthetase, type I  73.46 
 
 		 456 aa  724    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1635  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 456 aa  942    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1787  glutamate--ammonia ligase  46.19 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.683102  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  43.33 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.16 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.16 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  42.22 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  42.46 
 
 		 473 aa  382  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  42.22 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.31 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  42.11 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  43.04 
 
 		 475 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  43.34 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.89 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  42.44 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  42.04 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  43.1 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  41.23 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  42.35 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  42.32 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.89 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  42.8 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  42.41 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  39.62 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  43.49 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  42.68 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  41.61 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  42.62 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  41.1 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  41.44 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  41.6 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  40.08 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  42.53 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  42.11 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  42.95 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  39.83 
 
 		 477 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  43.13 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  40.97 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  42.04 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  41.95 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  41.89 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  42.07 
 
 		 474 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  41.68 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  42.35 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  41.68 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  42.23 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  41.68 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  42.07 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  42.07 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  42.07 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  40.08 
 
 		 473 aa  356  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  40.38 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  41.89 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  41.01 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  41.47 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  42.62 
 
 		 474 aa  352  8.999999999999999e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  41.28 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  40.46 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  41.26 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  40.09 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  40.21 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  40.34 
 
 		 470 aa  348  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  38.53 
 
 		 491 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  41.98 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  40.42 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  39.28 
 
 		 471 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  41.23 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  41.31 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  40 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  40.13 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  40.21 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  40.93 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  39.79 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  40.04 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  40.59 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  40.98 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  39.79 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  39.79 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  39.79 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  40.8 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  40.38 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  39.79 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  40.38 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  39.57 
 
 		 469 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  39.92 
 
 		 469 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  40.04 
 
 		 471 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  39.75 
 
 		 471 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  40.98 
 
 		 471 aa  338  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  40.42 
 
 		 471 aa  338  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  39.66 
 
 		 474 aa  338  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  39.53 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  40.55 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  41.01 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  40.17 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  39.96 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  39.96 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  39.16 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  41.23 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  39.66 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  39.32 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>