249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02860 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND02860  WD-repeat protein, putative  100 
 
 
899 aa  1842    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462814  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65683  U3 snoRNP protein  35.16 
 
 
951 aa  515  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08293  snoRNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04310)  33.74 
 
 
938 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0710686  hitchhiker  0.0000000000000896141 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37792  predicted protein  29.39 
 
 
934 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772788  normal  0.533349 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42495  predicted protein  28.05 
 
 
1233 aa  312  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 
696 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21 
 
 
1454 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
1236 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.96 
 
 
1363 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.15 
 
 
1523 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.27 
 
 
947 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.31 
 
 
1163 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 
1193 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 
1686 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.61 
 
 
1652 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.37 
 
 
1196 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  20.81 
 
 
1221 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.2 
 
 
1364 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.06 
 
 
1474 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.34 
 
 
1901 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.57 
 
 
1510 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.27 
 
 
1557 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.8 
 
 
1481 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.06 
 
 
930 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 
1188 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 
464 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  21.9 
 
 
1211 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.27 
 
 
1711 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.62 
 
 
1213 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.45 
 
 
1807 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21 
 
 
1831 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.2 
 
 
1188 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  24.27 
 
 
1242 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 
1229 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 
1552 aa  81.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  22.63 
 
 
1217 aa  81.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.01 
 
 
1760 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.24 
 
 
1684 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22 
 
 
1553 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  23.36 
 
 
1416 aa  79  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.42 
 
 
1367 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  22.33 
 
 
1357 aa  76.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.24 
 
 
1190 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.4 
 
 
1247 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.7 
 
 
1789 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 
1161 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.3 
 
 
924 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.82 
 
 
1661 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.47 
 
 
1161 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.94 
 
 
1443 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.15 
 
 
1599 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 
1427 aa  71.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.35 
 
 
1411 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 
792 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.62 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 
1279 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  22.55 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 
1656 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  22.68 
 
 
1279 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.54 
 
 
919 aa  67.8  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  20.75 
 
 
1348 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.61 
 
 
1399 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  21.45 
 
 
774 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 
677 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.95 
 
 
1714 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  22.09 
 
 
316 aa  65.1  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 
335 aa  65.1  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.98 
 
 
1072 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.01 
 
 
1626 aa  64.7  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.77 
 
 
1072 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
363 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.27 
 
 
1609 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.41 
 
 
1208 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.18 
 
 
1491 aa  63.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.64 
 
 
1214 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
363 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.89 
 
 
1262 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.31 
 
 
1205 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 
342 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.51 
 
 
630 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.34 
 
 
1598 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 
346 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 
443 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  19.24 
 
 
1190 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.81 
 
 
434 aa  61.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  27.01 
 
 
307 aa  61.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.49 
 
 
565 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.04 
 
 
740 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.62 
 
 
344 aa  60.1  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.36 
 
 
1004 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  19.47 
 
 
1484 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.26 
 
 
676 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  36.11 
 
 
1304 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  21.81 
 
 
1041 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 
589 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.53 
 
 
596 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  21.96 
 
 
1858 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  22.26 
 
 
578 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.08 
 
 
1039 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  19.15 
 
 
1868 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>