137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42495 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42495  predicted protein  100 
 
 
1233 aa  2537    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02860  WD-repeat protein, putative  28.05 
 
 
899 aa  311  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462814  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65683  U3 snoRNP protein  26.2 
 
 
951 aa  267  8.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08293  snoRNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04310)  28.76 
 
 
938 aa  249  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0710686  hitchhiker  0.0000000000000896141 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37792  predicted protein  25.86 
 
 
934 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772788  normal  0.533349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 
1427 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  21.23 
 
 
1196 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 
461 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.12 
 
 
1262 aa  63.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  23.57 
 
 
774 aa  63.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.07 
 
 
1211 aa  59.7  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 
1188 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.92 
 
 
1357 aa  58.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  29.84 
 
 
447 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 
1552 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 
1477 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.25 
 
 
778 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.67 
 
 
505 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  34.74 
 
 
1161 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  34.74 
 
 
1161 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 
1188 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  30.08 
 
 
564 aa  55.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 
716 aa  55.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.83 
 
 
1217 aa  55.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 
1221 aa  55.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  29.27 
 
 
522 aa  55.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.44 
 
 
1041 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.4 
 
 
1760 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 
443 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.25 
 
 
335 aa  54.3  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
1039 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  20.6 
 
 
1236 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.57 
 
 
574 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.48 
 
 
596 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  37.72 
 
 
336 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.11 
 
 
924 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.49 
 
 
792 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.42 
 
 
696 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
1831 aa  53.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 
833 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42488  predicted protein  25.3 
 
 
467 aa  52.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.206932 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  27.27 
 
 
782 aa  52.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.57 
 
 
642 aa  52.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.08 
 
 
1072 aa  52  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.08 
 
 
1072 aa  52  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.13 
 
 
947 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.75 
 
 
692 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  27.17 
 
 
840 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  30.54 
 
 
346 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.97 
 
 
676 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 
464 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  19.59 
 
 
1279 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.13 
 
 
919 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  19.59 
 
 
1279 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.35 
 
 
930 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 
1686 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.84 
 
 
565 aa  49.7  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.38 
 
 
698 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.64 
 
 
1209 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  33.03 
 
 
1364 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.96 
 
 
675 aa  49.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.32 
 
 
1076 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.75 
 
 
630 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.95 
 
 
1242 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  32.2 
 
 
540 aa  49.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.99 
 
 
1344 aa  49.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 
1399 aa  49.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.96 
 
 
729 aa  48.9  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 
1363 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 
1193 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01645  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
323 aa  48.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.686819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.93 
 
 
1229 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 
1474 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  20.43 
 
 
1280 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.94 
 
 
1190 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  27.64 
 
 
335 aa  47.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  31 
 
 
307 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.7 
 
 
1213 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.21 
 
 
1454 aa  48.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  26.05 
 
 
935 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  33.33 
 
 
215 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.88 
 
 
865 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 
1177 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.36 
 
 
1901 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  38.36 
 
 
813 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.67 
 
 
1652 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.02 
 
 
733 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 
1553 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 
1789 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 
366 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  24.28 
 
 
495 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.76 
 
 
1599 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14176  predicted protein  26.41 
 
 
438 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 
371 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 
1164 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  32.98 
 
 
434 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  32.26 
 
 
1367 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.34 
 
 
1711 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.67 
 
 
1481 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.38 
 
 
1004 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>