109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01660 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  591  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  66.67 
 
 
233 aa  308  6.999999999999999e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  67.1 
 
 
246 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  62.82 
 
 
258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  54.13 
 
 
250 aa  275  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  51.56 
 
 
241 aa  215  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  47.37 
 
 
240 aa  202  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  45.06 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  43.67 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  46.12 
 
 
242 aa  195  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.39 
 
 
248 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  42.54 
 
 
259 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.3 
 
 
259 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  45.63 
 
 
251 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  40.95 
 
 
271 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  42.11 
 
 
259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  47.4 
 
 
249 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  41.67 
 
 
259 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  47.4 
 
 
240 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  45.54 
 
 
238 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  44.79 
 
 
263 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.41 
 
 
243 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  44.28 
 
 
271 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  38.46 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  46.19 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  49.15 
 
 
245 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.77 
 
 
256 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  45.36 
 
 
267 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  42.13 
 
 
251 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  44.79 
 
 
240 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  42.93 
 
 
239 aa  168  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  38.08 
 
 
247 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  43.81 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  38.36 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.19 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  43.23 
 
 
240 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  42.19 
 
 
241 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.96 
 
 
250 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  43.55 
 
 
240 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  40.61 
 
 
255 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  37.44 
 
 
245 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  40.72 
 
 
268 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  35.39 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  37.56 
 
 
246 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  36.06 
 
 
257 aa  149  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  37.23 
 
 
236 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  32.62 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  34.35 
 
 
264 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  38.39 
 
 
252 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.54 
 
 
256 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  36.87 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  34.98 
 
 
270 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  36.5 
 
 
237 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  39.06 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  33.09 
 
 
280 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37.38 
 
 
250 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.5 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  34.7 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  35.26 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  33.77 
 
 
259 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  33.33 
 
 
298 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  35.1 
 
 
299 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  32.41 
 
 
254 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  28.97 
 
 
247 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  28.05 
 
 
245 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.55 
 
 
180 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  29.86 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.32 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  27.91 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  29.44 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  28.5 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.53 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.8 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.44 
 
 
203 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  24.47 
 
 
211 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  22.6 
 
 
217 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  24.74 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25.38 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  24.07 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  24.62 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  22.27 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  25.15 
 
 
212 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  24.11 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.46 
 
 
225 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43079  predicted protein  24.62 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  25.6 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
206 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  25.73 
 
 
207 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  23.73 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  23.73 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  23.98 
 
 
211 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  23.81 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  22.22 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  24.42 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  23.81 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  20.91 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.15 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  24.4 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>