62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04990 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  100 
 
 		 224 aa  470  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  47.45 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  41.75 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27881  predicted protein  37 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115527 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  34.67 
 
 		 199 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.78 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  27.38 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  25.62 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  25.98 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11795  predicted protein  40.98 
 
 		 63 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.937655  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25.37 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.88 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  21.62 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.55 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  25.13 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25.27 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  23.44 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  24.47 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  26.43 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  26.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  24.86 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  25.84 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  25.53 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  22.96 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.79 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  23.53 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.29 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.64 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  24.71 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  23.24 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.97 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.67 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.44 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  24.32 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  25.58 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  23.16 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  27.38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  26.9 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  22.35 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  22.35 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.14 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  24.4 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  28.67 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  25.97 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  23.66 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  23.35 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.58 
 
 		 196 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  20.59 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  21.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  27.27 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  20.91 
 
 		 289 aa  45.1  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  22.99 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  22.22 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  22.09 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  27.27 
 
 		 250 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  24.55 
 
 		 250 aa  42  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  27.27 
 
 		 269 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  23.78 
 
 		 227 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  25 
 
 		 281 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.596472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>