165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0916 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  87.19 
 
 
203 aa  364  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  83.74 
 
 
203 aa  353  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  80.3 
 
 
203 aa  342  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  52.63 
 
 
200 aa  222  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  52.15 
 
 
204 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  49.21 
 
 
196 aa  197  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  43.46 
 
 
196 aa  175  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  41.84 
 
 
198 aa  155  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  43.33 
 
 
201 aa  150  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  39.6 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  40.64 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  40.56 
 
 
201 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.93 
 
 
225 aa  141  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  36.32 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  39.44 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  36.65 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  38.22 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  38.42 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  35.91 
 
 
210 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  37.57 
 
 
211 aa  131  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  34.55 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  34.83 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 
206 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 
214 aa  121  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 
219 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 
219 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.64 
 
 
219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 
219 aa  118  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  36.41 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.58 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  32.63 
 
 
283 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  30.62 
 
 
227 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  34.24 
 
 
297 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.17 
 
 
250 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  31.84 
 
 
259 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.67 
 
 
301 aa  98.6  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  35.12 
 
 
234 aa  98.2  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  31.34 
 
 
259 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.3 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.35 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.35 
 
 
259 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.37 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  30.35 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.89 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.53 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.52 
 
 
237 aa  92.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  29.9 
 
 
246 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.98 
 
 
267 aa  87.8  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.02 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  33.51 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  29.95 
 
 
242 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  27.4 
 
 
237 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.77 
 
 
296 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  28 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  27.5 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30.43 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.35 
 
 
272 aa  82  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  26.92 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.51 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30.05 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  30.11 
 
 
248 aa  81.3  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  29.71 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  31.37 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.02 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  30.29 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.74 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  35.06 
 
 
237 aa  79  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  30.69 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  28.42 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.32 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.59 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  26.02 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.72 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  27.31 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  27.65 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  29.84 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  27.12 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  27.66 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  29.35 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  26.47 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.59 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  26.74 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.84 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  28.82 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  28.34 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  28.09 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  27.27 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  26.86 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  24.86 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  27.12 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  26.14 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  28.02 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  26.29 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>