116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0074 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  78.42 
 
 		 241 aa  401  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  52.72 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  51.87 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  50.63 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  49.35 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  49.58 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.07 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  45.04 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  51.45 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  47.58 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  47.14 
 
 		 259 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  45.96 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  43.98 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  46.7 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  45.49 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  42.74 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  45.45 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  44.78 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  47.37 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  44.02 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  44.64 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  45.79 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  44.4 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.11 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  47.89 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  46.45 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.64 
 
 		 245 aa  188  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  46.05 
 
 		 272 aa  187  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  52.11 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.88 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  50.53 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  39.66 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  44.21 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  41.07 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  38.91 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  39.64 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  39.3 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  38.46 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  39.55 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.91 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  40.64 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  39.23 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  42.35 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  37.91 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.4 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  36.22 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.55 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  36.91 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  37.4 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  39.2 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  34.89 
 
 		 299 aa  141  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  38.1 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  37.2 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.53 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  41.67 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  35.27 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  34.91 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  37.5 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  37.43 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  36.02 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  40.4 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  35.07 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  35.07 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.68 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  35.75 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  28.99 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  30.04 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  32.39 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  32.84 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.79 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  28.89 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.23 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.35 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.43 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  28 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.46 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.86 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  28.72 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.06 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.44 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.98 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.44 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.71 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.42 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.98 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  26.44 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.69 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.01 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.42 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  24.4 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.58 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.17 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.67 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>