96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05540 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  100 
 
 
299 aa  614  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  63.39 
 
 
259 aa  300  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  59.45 
 
 
299 aa  280  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  49.54 
 
 
269 aa  223  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  49.54 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  39.35 
 
 
236 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  43.08 
 
 
238 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.38 
 
 
241 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.6 
 
 
249 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  38.39 
 
 
259 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  37.78 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  38.57 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  38.79 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  39.6 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  37.95 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  38.53 
 
 
240 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  40.1 
 
 
241 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  37.33 
 
 
259 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  41.75 
 
 
263 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  41.33 
 
 
239 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  37.05 
 
 
259 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.5 
 
 
243 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  38.58 
 
 
240 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  32.01 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  43.02 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  39.49 
 
 
271 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  37.95 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.49 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  33.96 
 
 
255 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  40.34 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  38.31 
 
 
289 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  36.79 
 
 
240 aa  132  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.68 
 
 
235 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  35.11 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  40.46 
 
 
242 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  36.04 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  42.29 
 
 
231 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  39.04 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  35.22 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  36.74 
 
 
247 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.06 
 
 
251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  36.04 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.96 
 
 
271 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  37.9 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  33.64 
 
 
268 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  37.16 
 
 
270 aa  125  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  38.46 
 
 
250 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  32.68 
 
 
253 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  37.43 
 
 
240 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  38.12 
 
 
250 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.93 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
256 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  36.63 
 
 
245 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  35.2 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  36.93 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  35.32 
 
 
280 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  31.51 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.78 
 
 
250 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  34.4 
 
 
236 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.34 
 
 
256 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  33.87 
 
 
233 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  31.07 
 
 
245 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.18 
 
 
254 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  32.55 
 
 
246 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  28.74 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  29.22 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  32.97 
 
 
258 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  30.39 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.31 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  27.8 
 
 
238 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.62 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.36 
 
 
200 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  25.97 
 
 
203 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 
204 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.52 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.9 
 
 
210 aa  60.1  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  25.94 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25.97 
 
 
203 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.65 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.07 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  25.82 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
201 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  25.82 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  24.53 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.03 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  25 
 
 
219 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.38 
 
 
196 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.53 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  24.86 
 
 
217 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  24.84 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.81 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.72 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.27 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  23.96 
 
 
233 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>