113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1314 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  60 
 
 
245 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  43.91 
 
 
271 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  41.67 
 
 
240 aa  192  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  41.45 
 
 
249 aa  191  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.45 
 
 
241 aa  191  8e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  40.53 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  41.59 
 
 
259 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  42.11 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  41.15 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  39.04 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  38.98 
 
 
263 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.15 
 
 
259 aa  181  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  40.35 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  40.81 
 
 
238 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45 
 
 
243 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  39.21 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  40.71 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  44.33 
 
 
272 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  38.89 
 
 
240 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  40.36 
 
 
242 aa  175  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  38.67 
 
 
247 aa  174  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.04 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  40.81 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  38.63 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  38.53 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  38.86 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.18 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  42.19 
 
 
268 aa  168  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.44 
 
 
251 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  39.58 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  42.35 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  37.83 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.27 
 
 
245 aa  161  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  36.99 
 
 
267 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  36.99 
 
 
257 aa  156  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  36.32 
 
 
246 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  36.79 
 
 
237 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  38.1 
 
 
258 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  33.48 
 
 
255 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  36.41 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  38.86 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  34.2 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.58 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  42.13 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  37.76 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  32.82 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  32.5 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  33.76 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  37.29 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.04 
 
 
299 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  38.98 
 
 
259 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  34.01 
 
 
250 aa  123  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  35.87 
 
 
278 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  37.14 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  36.5 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  29.15 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.95 
 
 
246 aa  115  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  36.36 
 
 
246 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  32.55 
 
 
298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.45 
 
 
238 aa  108  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.33 
 
 
258 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 
256 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.26 
 
 
247 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  33.71 
 
 
180 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  33.15 
 
 
269 aa  98.6  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  33.15 
 
 
250 aa  98.2  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  32.84 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  28.03 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  29.53 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 
200 aa  82  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29.17 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.47 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  30.41 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.32 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.12 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 
204 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.64 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  27.71 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  24.4 
 
 
207 aa  62.8  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.71 
 
 
200 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  27.22 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  26.63 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  24.1 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  24.07 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  24.47 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  22.65 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  25.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  25.13 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  23.49 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  21.89 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>