121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0584 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  50.63 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  50.21 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  50.65 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  50.21 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  53.91 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  48.95 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.37 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  51.5 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  48.94 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  49.57 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  52.28 
 
 		 242 aa  224  6e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  52.72 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  53.14 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  48.54 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  51.45 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  48.28 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  51.5 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  49.14 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  52.36 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  46.44 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  44.44 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  47.83 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  44.35 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.22 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.22 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  49.13 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  45.97 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  43.7 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.09 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  49.34 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  47.85 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  46.48 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  46.15 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  45.49 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  45.54 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  43.1 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  39.76 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  40.43 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  44.71 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  40.81 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  39.24 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  43.81 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  45.59 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  40.42 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  39.81 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  44.85 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  39.66 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  37.71 
 
 		 278 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  43.08 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  37.6 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  40.7 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  41.89 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  47.62 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  36.29 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  40.1 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  40.1 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  38.5 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  38.3 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  38.8 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.19 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  37.85 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34.02 
 
 		 298 aa  121  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.7 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  35.06 
 
 		 180 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.19 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  33.15 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  36.36 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  32.54 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  33.67 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  33.68 
 
 		 203 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  33.68 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.79 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.96 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  32.04 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  28.71 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  29.41 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.79 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  31.66 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.72 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  32.35 
 
 		 200 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  30.95 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.95 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  28.72 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.48 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.71 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.46 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  29.15 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.78 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.42 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  27.17 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.71 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>