173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0189 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  97.72 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  88.58 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  76.56 
 
 		 217 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  50.48 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  52.2 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  49.03 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  47.83 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  49.76 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  49.75 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  47.87 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  44.71 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  46 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  45.6 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  38.19 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  42 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  43.39 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.29 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  42.08 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  40.54 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  35.71 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.71 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.04 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  36.32 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.83 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  39.46 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.42 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  37.22 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  35.64 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  32.14 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  34.41 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  35.26 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  36.56 
 
 		 282 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  35 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.58 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.55 
 
 		 259 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  32.72 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  33.64 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.92 
 
 		 282 aa  104  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.18 
 
 		 297 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  31.39 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  33.51 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  30.77 
 
 		 279 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  30.09 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  33.64 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  29.39 
 
 		 290 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  30.41 
 
 		 284 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  34.83 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  26.48 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  38.1 
 
 		 270 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  32.88 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  32.88 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  32.88 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  32.88 
 
 		 292 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  35.93 
 
 		 280 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  34.46 
 
 		 280 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.39 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  31.53 
 
 		 306 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  32.88 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  32.42 
 
 		 324 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  34.27 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  33.52 
 
 		 273 aa  89  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  32.26 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  32.75 
 
 		 279 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  34.3 
 
 		 302 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  29.63 
 
 		 278 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.12 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  30.65 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.79 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  29.95 
 
 		 285 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  31.91 
 
 		 288 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.52 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.44 
 
 		 274 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  31.08 
 
 		 303 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  33.16 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.73 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.52 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  33.33 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  28.71 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  30.09 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.42 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  28.18 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.35 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  35.2 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  30.11 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  32.43 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  27.96 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  32.97 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  31.66 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  35.33 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  28.37 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  29.5 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>