171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1254 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  63.92 
 
 
196 aa  261  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  51.6 
 
 
203 aa  206  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  52.36 
 
 
203 aa  205  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  49.48 
 
 
204 aa  197  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  49.21 
 
 
203 aa  197  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  51.83 
 
 
203 aa  197  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  49.48 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  42.39 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 
198 aa  144  6e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  41.99 
 
 
211 aa  141  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  39.04 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  41.94 
 
 
209 aa  138  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  40.64 
 
 
213 aa  138  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.21 
 
 
225 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  39.89 
 
 
211 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
200 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  37.36 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.86 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 
219 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 
219 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 
219 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  38.04 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  40.33 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  37.91 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  37.7 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  36.26 
 
 
243 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  35.98 
 
 
201 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  36.07 
 
 
200 aa  121  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  33.86 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  34.21 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  34.08 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  36.11 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.08 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.11 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  35.29 
 
 
283 aa  105  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  34.07 
 
 
301 aa  104  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.3 
 
 
250 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.83 
 
 
243 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  34.07 
 
 
297 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.15 
 
 
282 aa  99  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  33.15 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  33.85 
 
 
259 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
259 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  35.06 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.89 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  32.31 
 
 
259 aa  92.8  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  30.11 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  32.29 
 
 
259 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  27.17 
 
 
303 aa  86.3  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  32.79 
 
 
238 aa  85.5  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.09 
 
 
296 aa  84.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  27.83 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.77 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.96 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.61 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  27.37 
 
 
267 aa  79  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  25.38 
 
 
246 aa  77  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.74 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.14 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  32.46 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  23.59 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  30.77 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.74 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  29.47 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  29.76 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.92 
 
 
249 aa  72  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30 
 
 
245 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.64 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.5 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  27.86 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  30.05 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  29.35 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  29.79 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  22.63 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  26.95 
 
 
263 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  28.02 
 
 
284 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.63 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  28.65 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  28.99 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  25.13 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  26.32 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  27.62 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  28.32 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  22.58 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  26.46 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  27.62 
 
 
282 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  27.57 
 
 
324 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  25.84 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  25.77 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  25.97 
 
 
285 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  25.13 
 
 
257 aa  62.4  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  27.88 
 
 
270 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  23.5 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  29.93 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  25 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  27.07 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.7 
 
 
251 aa  61.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>