150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0702 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  98.46 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  97.68 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  91.12 
 
 		 259 aa  478  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  71.85 
 
 		 271 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  60 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  57.92 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  58.82 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  59.21 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  57.58 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  58.77 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  57.33 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  61.17 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  53.85 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  49.78 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  52.92 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  53.91 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.4 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50.43 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  51.5 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  52.16 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  54.84 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  51.69 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 245 aa  228  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.55 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.21 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  46.7 
 
 		 240 aa  216  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  46.05 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  49.08 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  43.64 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  45.29 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  42.31 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  41.3 
 
 		 289 aa  191  8e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.49 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  42.67 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  42.92 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  43.27 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  42.92 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  44.6 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  40.71 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.26 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  38.6 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  39.46 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  40.41 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  40.19 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  41.91 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.82 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  39.63 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  44.63 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.06 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  36.74 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.39 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  40.78 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  39.71 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.29 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.73 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  35.1 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  34.2 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  37 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  32.69 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  37.38 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37.04 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  38.07 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  38.2 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  36.72 
 
 		 180 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.75 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  33.87 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  34.6 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  32.52 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  34.41 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.14 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  34.33 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  33.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  33.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  33.64 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  34.84 
 
 		 219 aa  98.6  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.33 
 
 		 236 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  31.84 
 
 		 203 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.85 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.88 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.35 
 
 		 203 aa  92.8  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.76 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  34.71 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.53 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  33.54 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  31.96 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  32.34 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  30.58 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  38.1 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  33.73 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  34.73 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.98 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  32.26 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  33.53 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  33.73 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  29.65 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>