125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1365 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  79.31 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  73.71 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  67.81 
 
 		 241 aa  335  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  67.38 
 
 		 240 aa  332  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  67.38 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  67.4 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  66.98 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  61.14 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  60.7 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  60.7 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  67.86 
 
 		 259 aa  278  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  59.83 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  59.83 
 
 		 243 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  52.17 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  49.78 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.12 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  49.57 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  49.1 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  48.29 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.93 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.66 
 
 		 250 aa  224  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.58 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  49.33 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  47.62 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  48.28 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.96 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  45.49 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  48.56 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  45.61 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  44.3 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  43.64 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  43.78 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  47.4 
 
 		 289 aa  186  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  43.12 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  41.32 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  46.92 
 
 		 258 aa  181  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  38.63 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.38 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  39.21 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  39.84 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  37.91 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.4 
 
 		 235 aa  158  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.23 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  37.55 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  35.39 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.15 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  38.07 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  42.7 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  42.39 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  43.58 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  42.5 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.12 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  38.04 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.47 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.79 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.81 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  31.84 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  33.19 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  35.91 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  36.24 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  30.86 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  33.33 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  26.92 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  33.47 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.43 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.01 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  33.52 
 
 		 180 aa  101  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.68 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  31.34 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.33 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.98 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.19 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.94 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  30.22 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.64 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.04 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  30.22 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  30.22 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.08 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  28.07 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.31 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.12 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.37 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  24.64 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.12 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.87 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.07 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.75 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  27.72 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  23.98 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  30.95 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.69 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.79 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>