144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20007 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  61.09 
 
 
301 aa  298  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  56.92 
 
 
297 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  55.28 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  52.76 
 
 
296 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  52.28 
 
 
197 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  40.93 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  39.29 
 
 
212 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  38.58 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  35.15 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  35.75 
 
 
210 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  39.68 
 
 
213 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  39.57 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  34.16 
 
 
207 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  35.26 
 
 
200 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  35.45 
 
 
201 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.96 
 
 
210 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  32.85 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.72 
 
 
210 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  31.25 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.29 
 
 
196 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.58 
 
 
219 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  29.81 
 
 
198 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
200 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 
202 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  32.63 
 
 
203 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
203 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  31.66 
 
 
217 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.15 
 
 
225 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  33.86 
 
 
201 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.9 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.41 
 
 
203 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  30.89 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.81 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.69 
 
 
225 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.25 
 
 
204 aa  93.6  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  33.33 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  32.08 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  33.82 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.76 
 
 
237 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.73 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  31.31 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  32.18 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  30.6 
 
 
196 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.73 
 
 
233 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  29.73 
 
 
234 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  28.57 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  31.11 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  26.72 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  28.98 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  32.54 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  29.63 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  30.58 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  32.37 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  28.8 
 
 
200 aa  82  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  32.51 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  25.98 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.26 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.81 
 
 
217 aa  79  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  25.98 
 
 
259 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  27.75 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  28.12 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  25.49 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  34.13 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.56 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  28.64 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  27.17 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  26.32 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  28.12 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  29.26 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  27.56 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  29.06 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  28.07 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  27.06 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  28.43 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  28.86 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  25.59 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  30.98 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.72 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  26.48 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  27.11 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  27.11 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  27.11 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  26.2 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  26.32 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  28.19 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  30.06 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  25.15 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  26.13 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  25.5 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  25.88 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  24.43 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  25.6 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.51 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  23.98 
 
 
199 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  25.71 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  28.5 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>