177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0307 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  55.91 
 
 
200 aa  197  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  54.55 
 
 
201 aa  194  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  48.24 
 
 
210 aa  194  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  54.95 
 
 
202 aa  191  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  54.55 
 
 
201 aa  189  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  49.74 
 
 
211 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  50 
 
 
206 aa  174  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  47.37 
 
 
210 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  46.73 
 
 
219 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  46 
 
 
219 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  46 
 
 
219 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  51.05 
 
 
217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  45.5 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  45.45 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  46.81 
 
 
211 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  46.63 
 
 
225 aa  153  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  46.63 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  46.77 
 
 
213 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  47.85 
 
 
209 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  44.44 
 
 
207 aa  148  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  45.64 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  40.1 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.44 
 
 
196 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  37.95 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  37.76 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  38.42 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.48 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.8 
 
 
210 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  40.98 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.33 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  35.08 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.77 
 
 
243 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.62 
 
 
204 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  34.97 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  35.26 
 
 
283 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  39.15 
 
 
250 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  34.76 
 
 
198 aa  112  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  32.82 
 
 
303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  41.62 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  35.82 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  35.32 
 
 
259 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.24 
 
 
271 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.83 
 
 
259 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  32.84 
 
 
199 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.91 
 
 
301 aa  101  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  34.33 
 
 
259 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  36.32 
 
 
197 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  32.98 
 
 
225 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.38 
 
 
297 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  34.08 
 
 
267 aa  99.4  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  32.46 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.99 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  32.24 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  33.67 
 
 
238 aa  94.4  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  38.07 
 
 
240 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  28.21 
 
 
282 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  36.05 
 
 
249 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.55 
 
 
249 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  36.31 
 
 
272 aa  92  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  32.37 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  36.63 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.98 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  31.16 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  34.02 
 
 
247 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  33.91 
 
 
240 aa  88.2  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  28.74 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  33.16 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  31.03 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.88 
 
 
233 aa  84.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  29.9 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  32.37 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  28.57 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  29.33 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  27.13 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  31.98 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  31.47 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  36.27 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  33.51 
 
 
258 aa  81.3  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  31.79 
 
 
279 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  30.98 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.88 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  31.61 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  37.23 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  33.51 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  31.18 
 
 
290 aa  78.2  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  32 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  31.21 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  32.77 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  25.53 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  34.2 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.81 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  33.83 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  32.35 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.03 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  29.23 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  31 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>