146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0196 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  79.52 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  73.71 
 
 
240 aa  353  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  66.1 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  67.23 
 
 
240 aa  325  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  64.71 
 
 
241 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  66.38 
 
 
239 aa  321  7e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  59.17 
 
 
259 aa  291  6e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  58.75 
 
 
259 aa  289  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  58.37 
 
 
259 aa  287  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  56.54 
 
 
272 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  57.92 
 
 
259 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  58.16 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  59.4 
 
 
243 aa  268  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  50.44 
 
 
267 aa  242  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.33 
 
 
256 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  47.27 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.33 
 
 
249 aa  238  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.87 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  49.12 
 
 
247 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  48.94 
 
 
238 aa  226  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  47.19 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  45.96 
 
 
248 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  47.11 
 
 
251 aa  222  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  49.12 
 
 
268 aa  221  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  48.91 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 
241 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.98 
 
 
241 aa  219  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  47.23 
 
 
242 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  43.98 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  48.4 
 
 
245 aa  202  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  44.59 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  46.8 
 
 
245 aa  192  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  43.69 
 
 
246 aa  188  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  43.58 
 
 
257 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  41.15 
 
 
237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  44.79 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  37.07 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  38.98 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  40 
 
 
258 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  41.28 
 
 
250 aa  169  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  38.96 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  42.65 
 
 
250 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  36.36 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.07 
 
 
264 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  40.71 
 
 
280 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.86 
 
 
256 aa  158  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.4 
 
 
285 aa  155  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  40.09 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.92 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  37.55 
 
 
236 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  39.22 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.15 
 
 
250 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.11 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  41.75 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  39.63 
 
 
259 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
256 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  36.53 
 
 
254 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.39 
 
 
278 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  34.96 
 
 
299 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.47 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.27 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  38.97 
 
 
269 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  38.97 
 
 
250 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.64 
 
 
247 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.53 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.29 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  32.41 
 
 
258 aa  115  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  32.39 
 
 
180 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.18 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30.54 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  36.63 
 
 
200 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  34.1 
 
 
210 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.75 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  33.15 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.22 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.81 
 
 
203 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.42 
 
 
219 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.51 
 
 
203 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.55 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.97 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.97 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.97 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.57 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.61 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  29.12 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  31.82 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.86 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  30.96 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 
200 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  31.94 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.61 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  30.89 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.36 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.95 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  29.59 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.89 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.2 
 
 
209 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>