138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0963 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  72.73 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  72.11 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  71.9 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  71.66 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  69.64 
 
 		 247 aa  351  8.999999999999999e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  66.25 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  65.59 
 
 		 245 aa  328  7e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  63.36 
 
 		 268 aa  291  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  50.44 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  51.07 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  49.56 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  51.69 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  51.69 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  51.69 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  49.02 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  48.31 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  54.33 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.66 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  50.39 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  45.02 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  47.88 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.72 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  46.96 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  47.37 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  51.56 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  45.74 
 
 		 243 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.83 
 
 		 241 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  51.41 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  45.36 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  42.86 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  38.96 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  40.93 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  40.96 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  45.08 
 
 		 258 aa  172  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  40.47 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  43.94 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  40.98 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  38.25 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  38.05 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  39.47 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.74 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  41.55 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  34.12 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.06 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  34.93 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.96 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  32.3 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  40.55 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.44 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  33.51 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  37.38 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37.38 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  34.5 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  34.02 
 
 		 299 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  34.76 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  32.46 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  32.75 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  36.67 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  35.35 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  33.33 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  37.16 
 
 		 180 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  37.68 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.05 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  28.35 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  30.63 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  31.07 
 
 		 207 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  28.96 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  34.13 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.8 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.11 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27.88 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  34.2 
 
 		 200 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.37 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.1 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.67 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.86 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.86 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  29.29 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.67 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  36.13 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.29 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.74 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  31.07 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.04 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.75 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.5 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  25.87 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.94 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.67 
 
 		 203 aa  62  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.11 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>