89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04850 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  56.81 
 
 
254 aa  299  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  55 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  45.95 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  43.92 
 
 
245 aa  232  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  35.2 
 
 
249 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  35.66 
 
 
240 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  40.55 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  45.2 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  40.09 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  44.63 
 
 
259 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  40 
 
 
255 aa  148  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.71 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  35.66 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.74 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  33.07 
 
 
240 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  35.81 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.87 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  34.84 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  34.4 
 
 
236 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  34.78 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  36.41 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  35.78 
 
 
263 aa  138  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  31.1 
 
 
242 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  36.74 
 
 
241 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.68 
 
 
264 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  31.1 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.19 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  36.49 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  34.7 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  31.25 
 
 
285 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  33.82 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  32.13 
 
 
235 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  33.49 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  31.73 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.1 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.19 
 
 
256 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  38.67 
 
 
245 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  32.17 
 
 
243 aa  125  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  32.89 
 
 
245 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.87 
 
 
249 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  37.85 
 
 
238 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  33.05 
 
 
247 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.04 
 
 
256 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  33.63 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  32.63 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  31.88 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  31.76 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  35.96 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  32.74 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  33.78 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  32.31 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  33.66 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  29.2 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  32.2 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  32.65 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  31.58 
 
 
298 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  30.09 
 
 
236 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  30.45 
 
 
245 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  31.69 
 
 
237 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  32.04 
 
 
240 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.15 
 
 
258 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  34.29 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  30.24 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  30.24 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  30.32 
 
 
233 aa  95.1  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  28.4 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  28.57 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  25.79 
 
 
299 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  31.21 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  30.22 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.7 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  27.14 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.53 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.53 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.76 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  27.92 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  26.63 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.53 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  25.62 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  25.67 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.61 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.31 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  24.32 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  22.89 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.17 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  23.49 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  22.45 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>