100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03610 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  55.37 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  50.18 
 
 
298 aa  276  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  44.08 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  42.25 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  41.84 
 
 
259 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  41.84 
 
 
259 aa  158  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  40.86 
 
 
263 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  42.11 
 
 
271 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.33 
 
 
259 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  39.78 
 
 
248 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  40.82 
 
 
259 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  42.94 
 
 
249 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  36.98 
 
 
239 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  40.83 
 
 
240 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  40.54 
 
 
289 aa  145  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.76 
 
 
251 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.1 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.04 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
241 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  41.92 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  37.11 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.64 
 
 
256 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  35.87 
 
 
243 aa  138  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  36.7 
 
 
247 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  38.04 
 
 
240 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  33.6 
 
 
245 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  37.31 
 
 
235 aa  135  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.43 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  36.16 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  36.51 
 
 
245 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  41.86 
 
 
258 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  36.65 
 
 
246 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  38.8 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  38.3 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  33.51 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.38 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  37.43 
 
 
250 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  37.82 
 
 
231 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  36.51 
 
 
257 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  36.96 
 
 
253 aa  123  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  32.05 
 
 
268 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  37.23 
 
 
237 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 
256 aa  122  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  37.14 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  33.49 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.6 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  32.11 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  32.27 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  32.49 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  34.38 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  29.96 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  33.17 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  34.33 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  33.7 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  40.34 
 
 
299 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.16 
 
 
278 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  36.88 
 
 
233 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  31.86 
 
 
280 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  35.94 
 
 
299 aa  102  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  36.36 
 
 
269 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  36.36 
 
 
250 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  30.53 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  32.51 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  39.13 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  28.89 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  30.89 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  29.45 
 
 
200 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.5 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.93 
 
 
196 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.58 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.88 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.2 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.67 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.14 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  29.68 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.92 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.93 
 
 
200 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.57 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.14 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.45 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  30.28 
 
 
217 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.09 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  28.4 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.47 
 
 
225 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  26.06 
 
 
200 aa  47  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.25 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.49 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.73 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  23.08 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  25.4 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  24.5 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.05 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.05 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  23.94 
 
 
201 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>