130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1678 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  79.58 
 
 		 241 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  77.92 
 
 		 240 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  76.37 
 
 		 239 aa  374  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  68.68 
 
 		 272 aa  350  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  69.58 
 
 		 249 aa  347  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  67.38 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  66.1 
 
 		 263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  61.57 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  58.77 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  58.77 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  58.33 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  58.3 
 
 		 243 aa  266  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  55.17 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.52 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.1 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  51.67 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  52.54 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  49.58 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.55 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 267 aa  231  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  51.08 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  47.06 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  48.92 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.26 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  49.07 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  49.14 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  47.79 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.3 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.59 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  44.64 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  45.95 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  44.07 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  42.92 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  45 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  42.86 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  42.11 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  42.62 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  44.79 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  42.25 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  43.94 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  46.5 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.86 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  38.5 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  41.55 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.06 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.06 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  35.46 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  40.83 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.75 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  36.09 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  35.95 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.26 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.85 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.65 
 
 		 298 aa  135  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  35.11 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  32.49 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  34.76 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  34.11 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  32.92 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  35.12 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  33.2 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  36.45 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  37.5 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  27.59 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  33.52 
 
 		 180 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  32.53 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30.2 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.88 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  33.91 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  30.29 
 
 		 210 aa  85.1  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.57 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.43 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.43 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.43 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  30.77 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.89 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.96 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.29 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.68 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.76 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.75 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  31.28 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  32.14 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  30.18 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.76 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  26.6 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  31.55 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.13 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28.02 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  26.96 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  31.18 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.85 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  30.12 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>