109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63922 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  100 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  73.76 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  66.38 
 
 		 289 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  57.21 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  50 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.25 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  44.8 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  44.14 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  42.49 
 
 		 259 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  48.7 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  41.12 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  40.65 
 
 		 259 aa  164  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  45.24 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  40.64 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  43.78 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  40.19 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  44.85 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  41.04 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  40.26 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.72 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  46.49 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.53 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  40.18 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  41.82 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  37.89 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  45.86 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.62 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  42.22 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  39.37 
 
 		 247 aa  144  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  37.33 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  41.63 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  37.9 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  45 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.8 
 
 		 264 aa  138  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  36.87 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.66 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.66 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  38.69 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  36.7 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  43.45 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  32.58 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  45.68 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  37.62 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.33 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  40.45 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  33.62 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  35.23 
 
 		 285 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  38.89 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  36.32 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  33.33 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  34.74 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  35.29 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  30.8 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  31.08 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  33.87 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  32.99 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.88 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  35.39 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  35.83 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  31.05 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  30.32 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  31.47 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  33.33 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.01 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.88 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  25 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  28.9 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  30.05 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  28.85 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.65 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  27.73 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  25.98 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  31.25 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.02 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  26.21 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  25.7 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.05 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.76 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  23.7 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  24.28 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.73 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.73 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  23.2 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  24.85 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  22.84 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  25.53 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.12 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.4 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.79 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  26.99 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43079  predicted protein  29.55 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>