140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0514 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  48.28 
 
 
234 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.8 
 
 
243 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.51 
 
 
237 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.25 
 
 
243 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  48.82 
 
 
237 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  43.75 
 
 
243 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  39.27 
 
 
211 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  38.61 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  35.15 
 
 
219 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  34.48 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  39.15 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  38.97 
 
 
214 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  35.15 
 
 
219 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  37.97 
 
 
212 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  38.46 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  35.75 
 
 
210 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  36.76 
 
 
217 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.18 
 
 
203 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 
207 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.41 
 
 
225 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  36.67 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.3 
 
 
196 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  34.93 
 
 
209 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  34.17 
 
 
203 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  34.17 
 
 
203 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.72 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  32.46 
 
 
198 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  36.61 
 
 
201 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  31.82 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  34.39 
 
 
196 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  31.67 
 
 
200 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  33.52 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.65 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  31.87 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  31.61 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.35 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  26.6 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  32.81 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  32.56 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  27.72 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  27.89 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.48 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.45 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.65 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  28.95 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.89 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  24.23 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  29.35 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  26.32 
 
 
301 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.65 
 
 
201 aa  59.7  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.23 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  27.87 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  29.41 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  27.84 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26.73 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  27.27 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  25.59 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  27.08 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.75 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.7 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  30.85 
 
 
288 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  32.1 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.72 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  25 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  25.4 
 
 
303 aa  55.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  28.02 
 
 
273 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  27.05 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  26.14 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  26.92 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  26.5 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  27.55 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  31.39 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  29.51 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  27.23 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  25.53 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.14 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  28.57 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  30.56 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  30.43 
 
 
302 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.34 
 
 
304 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  29.51 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  28.02 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  27.22 
 
 
248 aa  52.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.57 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  30.57 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.47 
 
 
227 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  30.77 
 
 
324 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  28.03 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  29.49 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.67 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  29.56 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  26.42 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  28.3 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  25.68 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  27.84 
 
 
290 aa  48.5  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>