150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0019 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  100 
 
 
247 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  73.68 
 
 
251 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  73.28 
 
 
256 aa  362  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  72.61 
 
 
271 aa  361  5.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  72.92 
 
 
249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  68.85 
 
 
250 aa  352  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  69.23 
 
 
245 aa  342  4e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  73.28 
 
 
267 aa  338  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  61.54 
 
 
268 aa  285  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  51.97 
 
 
239 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  50 
 
 
241 aa  246  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  49.58 
 
 
240 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  49.36 
 
 
249 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  49.58 
 
 
240 aa  239  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  51.08 
 
 
243 aa  236  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  49.78 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  52.16 
 
 
259 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  49 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  52.16 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  49.12 
 
 
263 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  51.72 
 
 
259 aa  229  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  48.12 
 
 
271 aa  229  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.06 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  50.23 
 
 
272 aa  215  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  48.93 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  47.64 
 
 
280 aa  208  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  47.83 
 
 
238 aa  205  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  46.96 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  47.77 
 
 
243 aa  199  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  45.92 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  45.85 
 
 
245 aa  192  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.75 
 
 
241 aa  191  8e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  44.24 
 
 
270 aa  185  5e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  50.53 
 
 
240 aa  185  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  43.12 
 
 
257 aa  182  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  40.25 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  42.92 
 
 
245 aa  175  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  41.38 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  39.13 
 
 
237 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.4 
 
 
250 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  38.08 
 
 
289 aa  167  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  38.67 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.93 
 
 
255 aa  165  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  40.85 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  40.83 
 
 
250 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.06 
 
 
235 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  41.41 
 
 
231 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  30.66 
 
 
278 aa  148  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  38.99 
 
 
233 aa  142  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  34.63 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  33.21 
 
 
285 aa  139  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  37.31 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.7 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.33 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  35.56 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  38.46 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.74 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.36 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  39.55 
 
 
259 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 
256 aa  122  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  36.32 
 
 
299 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  39.55 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  39.55 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  37.9 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.06 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34.34 
 
 
298 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  36.72 
 
 
180 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.62 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  31.38 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.33 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.37 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  34.02 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.98 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  30.88 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  32.35 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.82 
 
 
219 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  30.32 
 
 
210 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  28.65 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  31.16 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  31.66 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  31.66 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.79 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  30.53 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  26.37 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  28.64 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  30.77 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.62 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  26.8 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.69 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.27 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  30.39 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.37 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.35 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  29.03 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.24 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  25.67 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>