166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2052 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
217 aa  443  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  74.75 
 
 
225 aa  303  9.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  47.89 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  47.18 
 
 
211 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  46.6 
 
 
211 aa  167  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  47.64 
 
 
210 aa  165  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  51.05 
 
 
200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  47.31 
 
 
213 aa  164  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  43.52 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  45.64 
 
 
214 aa  159  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  43.39 
 
 
217 aa  154  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 
209 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 
201 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  43.39 
 
 
219 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  43.39 
 
 
219 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  42.02 
 
 
219 aa  151  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  42.33 
 
 
219 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  44.39 
 
 
212 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  42.93 
 
 
200 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 
202 aa  148  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  39.39 
 
 
200 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  38.97 
 
 
201 aa  141  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  41.24 
 
 
206 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  37.17 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.66 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  34.55 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 
204 aa  129  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  34.03 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.7 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  39.15 
 
 
196 aa  125  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  32.46 
 
 
203 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  35.92 
 
 
243 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  33.16 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  36.76 
 
 
250 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.16 
 
 
243 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.09 
 
 
243 aa  95.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  30.89 
 
 
283 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  30.39 
 
 
297 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  35.98 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  33.85 
 
 
303 aa  92.8  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.88 
 
 
296 aa  92  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.98 
 
 
282 aa  91.7  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  34.15 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  31.87 
 
 
272 aa  88.2  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.52 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.28 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  33.54 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  30.15 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.32 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.51 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  34.1 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.05 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  30.53 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 
268 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.44 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  29.27 
 
 
273 aa  78.2  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  27.59 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  31 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.8 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  31.79 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  29.17 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  29.12 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  31.63 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.55 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25.38 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.82 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  26.86 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  25.65 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.05 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.24 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  29.12 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  29.53 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  32.63 
 
 
288 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  27.36 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.24 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  31.31 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  21.63 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.93 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  24.77 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  31.79 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  31 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  26.15 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25.41 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  27.49 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  29.36 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  27.04 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  31 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.96 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  24.44 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  31.79 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  27.06 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  30.46 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  26.9 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  24.15 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  26.59 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>