176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0123 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  55.61 
 
 
211 aa  216  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  51.44 
 
 
212 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  50.49 
 
 
213 aa  201  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  48.53 
 
 
211 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  48.56 
 
 
207 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  48.57 
 
 
210 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  51.89 
 
 
214 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  51.78 
 
 
209 aa  184  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  46.97 
 
 
217 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  43.69 
 
 
219 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  43.69 
 
 
219 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  43.33 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  42.72 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  42.23 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  43.24 
 
 
243 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  42.62 
 
 
200 aa  145  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  38.86 
 
 
210 aa  144  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  39.78 
 
 
201 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.67 
 
 
196 aa  138  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  39.25 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  36.98 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  33.5 
 
 
203 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  37.1 
 
 
200 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 
203 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  39.01 
 
 
196 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  36.02 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.33 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.77 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.11 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.62 
 
 
203 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.95 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  32.43 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.71 
 
 
234 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  40.7 
 
 
237 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  33.88 
 
 
283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  38.62 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  34.87 
 
 
197 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  34.41 
 
 
301 aa  101  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.47 
 
 
297 aa  98.6  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.98 
 
 
282 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  31.46 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.59 
 
 
296 aa  95.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.68 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.66 
 
 
268 aa  92  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.65 
 
 
225 aa  91.3  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  27.36 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  31.43 
 
 
259 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.73 
 
 
249 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.9 
 
 
243 aa  89.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  31.13 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.81 
 
 
267 aa  89  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  30.95 
 
 
259 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  31.12 
 
 
303 aa  88.2  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.72 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  30.69 
 
 
272 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.74 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.48 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  29.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.17 
 
 
247 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  27.67 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  27.01 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  29.36 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  27.98 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  26.82 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  28.65 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.94 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30.64 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  30.62 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  29.38 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  23.96 
 
 
246 aa  79  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  27.57 
 
 
242 aa  79  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  29.77 
 
 
263 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  26.17 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  32 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  30.06 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  25.94 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  30.89 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.64 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  28.74 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  26.27 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.46 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  26.2 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  27.88 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  24.54 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  25 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  30.19 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  26.39 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  26.32 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  25.35 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  25.82 
 
 
240 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  28.57 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.88 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  25.7 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  23.96 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  25.29 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>