77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53939 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  100 
 
 		 245 aa  513  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  48.36 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  49.21 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  43.92 
 
 		 256 aa  232  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  46.15 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  32.91 
 
 		 236 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  32.2 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  30.7 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  29.88 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  30.51 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  30.51 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.29 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.67 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  26.92 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.44 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.08 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  31.79 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.04 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  29.82 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.42 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  28.99 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  27.59 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.25 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  31.38 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  28.16 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.29 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  31.51 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  25.99 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  28.09 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  31.09 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  29.54 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  31.07 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  30.21 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  24.9 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  28.05 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  30.57 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  25.53 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  30.21 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  31.82 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  27.46 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  30.04 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  29.82 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  29.65 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  27.1 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  29 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  25.93 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  31.82 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  31.46 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  28.09 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  29 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  29.25 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  32.51 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  25.42 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  28.63 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.67 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  29.21 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.4 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  30.39 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  30.1 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  27.27 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  29.3 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  27.27 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.94 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  27.85 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  30.1 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  30.1 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  25 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.46 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  29.01 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  25.86 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  24.06 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  23.47 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  23.33 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25.9 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  22.27 
 
 		 211 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  26.81 
 
 		 206 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>