132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1742 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  58.01 
 
 
243 aa  298  6e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  56.78 
 
 
242 aa  298  7e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  58.97 
 
 
251 aa  298  8e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  54.7 
 
 
241 aa  290  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.19 
 
 
241 aa  249  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 
259 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  50.22 
 
 
259 aa  245  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  49.78 
 
 
259 aa  242  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  49.58 
 
 
240 aa  242  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  50 
 
 
259 aa  242  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  49.57 
 
 
240 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  47.68 
 
 
241 aa  228  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  49.57 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  47.06 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  46.94 
 
 
239 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  45.96 
 
 
263 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.5 
 
 
251 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  47.26 
 
 
240 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.07 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  51.12 
 
 
271 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  45.06 
 
 
249 aa  218  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  44.35 
 
 
271 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  50.99 
 
 
243 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  44.58 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  47.21 
 
 
250 aa  210  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  49.3 
 
 
245 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  45.02 
 
 
267 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  42.52 
 
 
272 aa  198  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  46.61 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  47.39 
 
 
289 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  51.4 
 
 
245 aa  188  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  40.61 
 
 
268 aa  187  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  41.45 
 
 
270 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  43.66 
 
 
250 aa  175  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.33 
 
 
245 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  45.16 
 
 
233 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  39.06 
 
 
246 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.31 
 
 
255 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  40.37 
 
 
257 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  38.53 
 
 
240 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  37.61 
 
 
235 aa  165  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  39.81 
 
 
253 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.9 
 
 
285 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  39.78 
 
 
256 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  39.39 
 
 
237 aa  153  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  45.16 
 
 
246 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  35.66 
 
 
250 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.96 
 
 
278 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  37.45 
 
 
250 aa  148  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.19 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  38.46 
 
 
231 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  34.93 
 
 
246 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  39.32 
 
 
280 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  34.78 
 
 
264 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  39.8 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  33.74 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  34.16 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  35.9 
 
 
247 aa  132  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  34.87 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.18 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  36.82 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.82 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  37.91 
 
 
250 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  37.91 
 
 
269 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  30.57 
 
 
236 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  32.02 
 
 
258 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  35.23 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30.69 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.06 
 
 
238 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  32.34 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  35.8 
 
 
204 aa  85.9  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  34.47 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  33.17 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.37 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  36.31 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.69 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.95 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  31.25 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  34.91 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  34.91 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  34.32 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.23 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.7 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  29.94 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.05 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.13 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  29.47 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  29.82 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  30.49 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  28.43 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  30.72 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 
200 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  27.6 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  27.92 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.42 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>